生信学习的app store:anaconda>miniconda>conda
命令 | 作用 |
---|---|
conda | 看conda提供的一些基本信息 |
conda list | 安装了哪些软件 |
conda config --get channels | 查看channels |
conda config --remove channels | 移除某个channels |
conda config --add channels | 增加某个channels |
conda install softwarename(=version) (-y) | 用conda安装某软件,y表示安装过程中有回答yesno问题时都回答yes |
conda update softwarename | 用conda更新某软件 |
conda remove softwarename | 用conda卸载某软件 |
uname -a | 查看服务器是多少位 |
清华源:
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
中科大源:
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --set show_channel_urls yes
难点----conda环境设置(不太懂,还要继续琢磨
)
Python 项目一定要隔离环境!
command | function |
---|---|
conda info --e | 查看当前有哪些环境 |
conda env list | 查看当前有哪些环境 |
conda create -n your_env_name python=x | 创建python版本为x,名字为your_env_name的虚拟环境。 |
conda activate 环境名 | 激活某个环境 |
conda deactivate | 退出环境 |
知识点:安装conda之后,系统前面出现“(base)”
这个base有和没有都是一样,新版本的anaconda才会出现这个base,老版本的不会。这个东西就是起到一个提示作用,因为base环境是默认的,不指定环境其实就是base环境,不过没有经过严格检测,但是理论上是没有问题的。
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