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如何从转录组数据中判断样本来源于雄性还是雌性?

如何从转录组数据中判断样本来源于雄性还是雌性?

作者: 佳名 | 来源:发表于2022-03-22 10:19 被阅读0次

    一个简单的想法是看它是否表达Y染色体上的基因,但随之出现的另一个问题是,即使是雄性,大部分体细胞也不表达Y染色体基因。如雄性的特征基因SRY。
    反倒是雌性大部分体细胞会比雄性多表达某些基因,如,XIST,转录组数据查看转录起始位点 - 简书 (jianshu.com)
    它的功能是使雌性动物两条X染色体其中一条随机失活,成为巴氏小体,从而和雄性X染色体表现出相等的效应。
    即使是分离的细胞系,也保留了这一特性。

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