maker注释篇二(ID转换)

基于上一步我们获得了初步的gff及rna和蛋白文件，maker生成的文件id是默认的，我们可以用maker自带的脚本进行更改。

• 生成maker默认id和需要改的id的对应关系

$maker_map_ids --prefix GENEK --justify 8 dpp_contig.all.gff >id.mappping
## --justify 指定名字的位数  ##id.mappping：生成对应关系

对应的fasta名称也可以用maker的脚本进行更改

$map_fasta_ids id.mappping dpp_contig.all.maker.transcripts.fasta
$map_fasta_ids id.mappping dpp_contig.all.maker.protein.fasta

transcripts
protein

对应的gff的id也可以用maker的脚本进行更改

$map_gff_ids id.mappping dpp_contig

gff