CAFE5 的下载,下载完以后可以上传至Gitee( Gitee - 基于 Git 的代码托管和研发协作平台 )。
CAFE5 的下载[https://github1s.com/hahnlab/CAFE],下载完以后可以上传至Gi...
基因家族扩张和收缩分析 基因家族的扩张和收缩分析一般会使用orthoMCL进行同源基因识别,然后选择直系同源基因进...
基因家族的扩张收缩分析中,基于单个物种的的扩张收缩基因家族可使用该物种的基因集作为背景基因集;但如果分析某个祖先节...
CAFE: Computational Analysis of gene Family Evolution (Ve...
以下参照 hoptop的「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析这篇帖子试跑了一遍 1.软件安装...
今来做一哈基因家族收缩与扩张吼用到的软件是 CAFE [基因课 提供的sif环境] 实验室祖传pipeline 后...
最近刚返校,事情比较多,每天也很忙,之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建(上)》也一直没来得及更新,缺...
前言:因为最近陆陆续续接手了几个物种的基因组项目,这也是生信分析中很大的一块。其中最基础的是组装和注释(当然我们实...
比较基因组学分析目录 1:单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p...
====环境和测试数据准备===== 需要先安装OrthoFinder,这个参考前面一个帖子。然后今天我们主要来测...
本文标题:CAFE5 基因家族扩张与收缩分析
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