FFPE空间转录组 给您的空间生物学更多可能

技术背景及介绍

保存在医院或者组织样品库中的样品，绝大多数是FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）处理的样品。数量巨大的样品资源蕴含着无限的科学研究机会，同时也是研究者们很棘手的研究对象。

如何获取FFPE样本的空间转录组信息呢？

为了解决这一问题，10x Genomics提出了Visium FFPE空间基因表达解决方案——Visium Spatial Gene Expression for FFPE tissue samples。该技术是空间转录组技术的又一拓展，突破过去从FFPE组织中获取空间全转录组基因表达信息的障碍。通过对整张组织切片进行分析，来消除需要预先选择感兴趣区域的相关方法带来的局限，以免错过重要的生物学信息。通过优化的空间FFPE全转录组方案，能够从FFPE样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的表达，在形态学背景下实现真正的探索发现。

工作原理

技术亮点

l 充分利用已存档的生物库样本进行生物标记物发现

l 进行回顾性研究和纵向研究，以追踪特定时间内的生物学过程

l 通过结合免疫荧光技术，同时进行蛋白和基因表达可视化检测

l 与H＆E技术结合进行形态学分析，充分挖掘珍贵的组织样本中的信息

技术特性

1.检测组织所有基因，不需要预先确定的生物标记。

2.完整的组织切片覆盖。

3.独特的RTL探针设计，对人和小鼠FFPE组织切片中的整个转录组进行高特异性和高灵敏度的检测。

4.与组织学染色的相容性，如H&E和IF，使形态学背景或蛋白联合检测与全转录组分析相结合成为可能。

5.系统化的解决方案，高效专业。