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Ribo-seq建库测序原理和应用

Ribo-seq建库测序原理和应用

作者: Hayley笔记 | 来源:发表于2023-07-20 12:02 被阅读0次

    1. RNA的翻译

    翻译过程

    2. 什么是Ribo-seq

    翻译组测序(Ribo-seq)是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。

    Ribo-seq是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribosome footprints, RFs),然后对这些被核糖体保护的30nt左右的RNA片段进行富集、深度测序、分析。

    Ribo-seq可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等,结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析,可以更精确地研究转录后调控、翻译调控机制

    3. Ribo-seq的方法原理

    2009年science杂志最早提出了Ribo-seq的技术

    4. Ribo-seq能解决什么科学问题

    5. 单细胞Ribo-seq

    Single-cell Ribo-seq reveals cell cycle-dependent translational pausing; Nature. 2021 Sep;597(7877):561-565.

    参考:

    1. 介绍Ribo-seq原理和应用_达澈生物

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