在pyradiomics软件的使用过程中,我们经常使用的命令是:
pyradiomics fpath.csv -o feature.csv -f csv --param exampleCT.yaml
在这个命令中,fpath.csv
是记录图像与ROI路径的文件,需要我们自己制作。对于不熟悉编程的pyradiomics用户来说,借助windows自带的功能来制作,是最好的选择。制作的流程如下:
- 打开一个空白的excel表格,设置表头分别为Image与Mask的数据列。
-
找到原始数据文件,1)选中所有的文件,2)拷贝所有数据的路径(仅适用于windows10的操作系统,win7需要,选中图像,按住
image.pngshift
键,点击鼠标右键,出现copy as path),3)粘贴到Image列下面。
image.png -
同2的操作,将ROI的文件路径添加到Mask列下面,确保每一行与Image是一一对应的。
- 将excel表格另存为以逗号为分割符的
.csv
文件。
image.png
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