主角和一群超级英雄在一座城堡救一个关键小女孩，在电梯时遇到了追捕的特工，楼外有超能者接应，但遇到敌对超能者暴风袭击，超级英雄们被打败，主角逃到城堡门口遇到化身僵尸大军，逃避上城堡塔楼，发现全世界都在混乱中。
于是主角一路逃避，发现各类宗教四起，人类极意受狂热思想影响，然后变成僵尸。逃到一座山上，各类宗教人士在不同高度的山岭间打坐修行，他们希望通过宗教的自修和洗礼来净化不知来源的狂热思想侵蚀，但很快从最底部开始都慢慢被影响，只有最顶上的一个人还克制着在翻看一本书。
主角在最顶处智者的指引下，躲在了山顶的一处洞穴藏身处。不知多少年过去，一只猴子过来洞穴口摘水果，四目相对，伸手相握，方知世界已经改变。于是主角决定下山，在山下原来的人类城市看见地面有很多机器在清理，有僵尸人类在迷茫中苏醒，世界还是那么大，但是一切都在重生。
遇到了之前的世界守护者，主角认定它是叛徒，和它交流，回应外星语：“能力强者占有世界，大世界的人不关心小世界的想法。”主角对答：“蚂蚁也能让人知道自己的强大。”但转念一下，蚂蚁是随时可能被踩死的，果不其然，世界立马有了骚动，那些原本苏醒的人类又变得疯狂，很多清理机器朝他而来。
主角拼命逃跑，来到了世界的边缘断崖，清理机器紧追不舍，无奈跳下断崖，只感觉到身体在一点点被抽空，远远看见新世纪刚刚苏醒的人都在蒸发。在断崖边缘有一个守护者一直在追着他，用机器扫描能够感应到主角在峡谷下面也在一点点被吸收蒸发，但是机器不能下来。断崖分界线似乎拥有神秘的力量。
不知过了多久，守护者带领一堆僵尸从峡谷上跳了下来，系统发现主角还有生命信号，决定要铲除他。断崖下面是守护者宣称的死亡禁地，传说那里有吃人的恶魔和不受控制的怪兽，进入的人类从无归来者。主角发现断崖下面是一片原始森林，他决定逃进原始森林世界。在危机关头，原始森林里冒出来一群精灵战士，他成功获救。路上看见原始森林世界里如蚂蚁一样的小动物建成的倒顶小屋，他感觉到蚂蚁也可以进化到如此强大，让人类害怕，那么人类也可以。
来到一处精灵世界，救他的朋友回来了，介绍了一位导师给他，那位导师原是上世界的主宰者，由于不同意上世界主宰集体把人类当实验的行为，她相信一切皆有生命和灵力，然后她被上世界放逐，于是逃离到上世界无法监控的原始森林。来到原始森林后，她帮助小生命进化。她现在培养出了一个庞大的精灵武装，他们愿意代表地世界一起反抗世界主宰者。在导师的旁边他遇到了故事开始时的两个超级英雄，他们也不知道来到这里多久。
和原始森林的动物精灵一起，他们决定让世界主宰者感受到进化真正的力量。一场地世界反抗上世界主宰者的战争，即将到来。
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