9#pan-genome#rice#

作者: 董八七 | 来源:发表于2022-01-29 10:32 被阅读0次

    Wang W, Mauleon R, Hu Z, et al (2018) Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice. Nature 557:43–49. doi: 10.1038/s41586-018-0063-9

    分析了3000水稻基因组项目中3010个亚洲栽培水稻(Oryza sativa L.)基因组的遗传变异、群体结构和多样性。结果与之前确认的五个主要群体一致,但也表明了与地理位置相关的几个未报告的亚群体。发现了2900万个SNP、240万个indels和9万多个结构变异,这些变异导致了群体内和群体间的变异。泛基因组分析发现了超过1万个新的全长蛋白质编码基因和大量存在-缺失变异。在驯化基因中观察到的复杂的导入模式与多个独立的水稻驯化事件一致。数据的公开为水稻基因组学研究和育种提供了资源。


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