22年9月的一篇CR
1. Distinct Transcriptomic Signatures of Myeloid Cell Aggregates in CS
Fig 1A： CS, GCM, 和 lymphocytic myocarditis 形态特征类似，存在大量髓系细胞浸润。（Granulomatous inflammation composed of epithelioid histiocytes and scattered multinucleated giant cells are present in CS and GCM, while a mixed lymphohistiocytic inflammation in an interstitial pattern is commonly found in lymphocytic myocarditis）
Fig 1B： 为了探究这些疾病中髓系细胞的转录差异，作者整合了三种疾病的DSP数据中的CD68+巨噬细胞。
Fig 1C-E： 结果显示和另外两种疾病相比，CS的巨噬存在不同的转录特征。和GCM相比，CS巨噬存在3044个上调基因，和LM相比，CS巨噬存在1496个上调基因。其中有1280个基因和两种疾病相比都上调。
Fig 1F-H： 这些共有上调基因主要与单核巨噬细胞分化 (CHIT-1, CHI3L-1, RUNX1 and GPNMB), 抗原呈递 (HLA-DRA and HLA-DRB1), ECM降解 (MMP9), 溶酶体 (LAMP2), 和炎症 (LYZ, CCR5, CCL5, CXCL9, FKBP5, and STAT1)相关。富集分析结果显示存在Inflammatory, lysosome, JAK-STAT 和 Toll-like receptor signaling pathways的富集。
In summary, these data showed that myeloid cells in CS exhibit a distinct transcriptomic profile compared with those in GCM and lymphocytic myocarditis.
2. Cellular and Transcriptomic Landscape of Inflammation in CS
Fig 2A-D： 随后作者对4例CS样本进行了单核细胞测序，得到12个细胞群。对髓系细胞的二次聚类得到6个群。
Fig 2E-F： 轨迹分析提示组织原位巨噬细胞Mac_Res和第四群Mac_GPNMB的Entropy最低，pseudotime最高，提示这两群代表着most differentiated cell states。（嗯...不是特别有说服力）
Fig 2G： 在鉴别了亚群之后，使用免疫荧光染色鉴定了空间关系。结果显示GPNMB主要存在于multinucleated giant cells，提示Mac_GPNMB 代表多核巨细胞。HLA-DR染色存在于紧密包绕在多核巨细胞边缘epithelioid macrophages。SYTL3 和 CD163 染色显示其分散存在于肉芽肿中多核巨细胞间。CD1c树突和 CD16a 非经典单核则存在于肉芽肿周围。这个模式在所有患者样本中都被观测到（n=14）。
Together, these data highlight the complex heterogeneity and spatial distribution of myeloid cell populations in CS. Moreover, we have identified GPNMB as a molecular marker for multinucleated giant cells in CS.
3. Mammalian Target of Rapamycin Pathway Activation and Macrophage Proliferation in CS
Fig2e, f中提到Mac_Res和Mac_GPNMB代表着most differentiated cell states，所以这一部分作者首先对Mac_Res进行了进一步分析。
Fig 3A-C： 和其他髓系细胞相比，Mac_Res存在621个上调基因，主要参与免疫调节如mTOR信号通路。此前有文献报道mTOR信号通路参与肺淀粉样变，但其机制不明确。
Fig 3D-E： p-S6 (phospho-S6 ribosomal protein)是mTOR信号通路活化的标志，免疫染色提示不同患者存在异质性的p-S6活化。此外，肉芽肿中p-S6活化与增长基因Ki67的表达呈显著正相关。
Fig 3F-G： 随后作者在不同亚群中检测了p-S6的表达情况，结果显示Mac_HLA-DR 和 Mac_SYTL3 存在最高水平的 p-S6 染色, 而多核巨细胞 (Mac_GPNMB) 存在 minimal p-S6 染色，而组织原位巨噬的p-S6也较低。
Taken together, these results suggest that the cardiac sarcoid granuloma is comprised of diverse myeloid cell types arranged in a stereotypic pattern. Moreover, our findings raise the possibility that mTOR activation may regulate expansion of specific macrophage subsets including Mac_HLA-DR and Mac_SYTL3 subclusters. （这个fig说了啥？感觉啥也没说啊）
4. Multinucleated Giant Cells Display a Specific Transcriptional Regulatory Network
Fig 4A-B： 为了进一步明确Mac_HLA-DR, Mac_SYTL3, Mac_GPNMB, DC_CD1C, 和 mono_ FCGR3A 与 Mac_res 相比的功能，作者进行了差异和富集分析。（哈哈哈 没有对照sample就拿Mac_res当对照，怪不得前一个fig先看了Mac_res）结果显示Mac_GPNMB特异性富集到lysosomal 和 PPAR通路。
Fig 4C-D： 随后作者做了SCENIC分析，ARID5B、NRIH3、MITF和TFEC regulons在Mac_GPNMB中特异性富集。
Fig 4E： 转录因子调控网络提示Mac_GPNMB中这些TF参与调控了很多基因，包括GPNMB, SNTB1(beta-1-syntrophin), TPRG1 (tumor protein P63 regulated 1), FBP1 (fructose-1,6-bisphosphatase 1)。
Fig 4F： 此外，DSP数据中，和GCM和MP巨噬相比，CS巨噬特异性高表达的基因，有很多是Mac_GPNMB中特异性表达的。
5. Mac_GPNMB Subcluster Is Specifically Identified in CS 为了探究
Mac_GPNMB是否是CS特有，作者从公共数据中找了ICM（缺血性心脏病），NICM和对照的心脏数据，使用CS的髓系细胞注释结果进行了映射。结果显示Mac_GPNMB几乎只存在于CS心脏。
These data support the conclusion that the Mac_GPNMB cluster is specific to CS. GPNMB and HLA-DR immunostaining distinguish CS from other forms of myocarditis.
We identified a specific staining pattern for CS granulomas: GPNMB+ multinucleated giant cells cuffed by HLA-DR positive epithelioid histiocytes(Figure 2G).
随后作者想要去探究这种特征区别不同心脏疾病的clinical utility，结果显示只有CS存在这种特征。
These data highlight a distinct organization of GPNMB+ and HLA-DR+ macrophages in CS (Figure 6F), which may provide diagnostic utility in differentiating CS from other forms of myocarditis including GCM.
Mac_GPNMB是巨细胞，这些疾病里头本身也就CS和GCM有巨细胞，其他病都没有，只看有没有巨细胞不久能区分吗，何必这么麻烦要染色呢？
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