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设计并行算法的思路(1)

设计并行算法的思路(1)

作者: 荷茗 | 来源:发表于2019-04-15 15:34 被阅读0次

    1. 模型抽象

    一般来说如果一个问题可以被抽象为一个 DAG(有向无环图)那么这个问题都可以用来并行计算。常见问题可以抽象下面两种模型。

    1) for 循环的展开。

    for(int i = 0 ; i < N ; i++)
      work(i);
    

    这种问题可以分解为 N 个问让 p 个 cpu 同时计算。

    2)divide and conquer, 分治算法。

    int work(int start, int end){
      if(end -  start  < N){
        //do some thing
      }
      work(start, (star+end) / 2 );
      work((star+end) / 2+1, end );
    }
    

    通过divide 的方式将问题划归为一列不相关的子问题,这些子问题可以同时被顺序解决。这样也提高了工作效率。常见的例子为,快速排序和归并排序。

    2. 问题分析

    对于样的模型,我们如何对它们进行量化分析呢?在这里需要定义两个指标 work 与 span。

    Work 是在顺序执行的情况下的总计算复杂度。也就是我们常说的计算复杂度。

    Depth(span) 是指每个处理器被分配的任务。通常情况下是一个 DAG 图中最长的路径(如如图中的黄色的路径)。

    image

    几条定律

    在分析时间复杂度的时候,我们暂时抛开内存和通信上面的开销。

    1 speed up

    S_{p} =\frac{W}{T_{p}}

    2 时间复杂度的下界

    T_{p} \geq \frac{W}{p}, \ \ T_{p} \geq D \rarr T_{p} \geq \max\{ \frac{W}{p}, D \} 其中 p 是处理器的数量,D是上面提到的 span

    3 时间复杂度的上界
    image

    为了证明上界,我们讲将整个 DGA 图转换为上图的的模式。可以分割为一个个的 phase(图中的黄色分割线),中间的蓝色点就是 critical path,也就是我们之前讲的 D 。这个新的图有如下性质:

    1. 每一个critical 路径上的一个节点就是一个 phase。
    2. 同一层上左右两边的非关键路径上的node代表一组task,他们之间没有相互依赖。
    3. DAG 图中的每一个点都会出现在一个 phase中。

    W_{i} 代表每一个phase里面的work数目。 T_{i} = \lceil \frac{W_{i}}{p}\rceilT_{D} = \sum ^{D}_{i=1}\ \lceil \frac{W_{i}}{p}\rceil =T_{D} = \sum ^{D}_{i=1}\ \lfloor \frac{W_{i} - 1}{p}\rfloor + 1

    这里有由 ceilling 的转化公式 \lceil \frac{a}{b}\rceil = \lfloor \frac{a-1}{b}\rfloor + 1 转化而得。

    \sum ^{D}_{i=1}\ \lfloor \frac{W_{i} - 1}{p}\rfloor + 1 \leq \sum ^{D}_{i=1}\ \frac{W_{i} - 1}{p} + 1 = \frac{W-D}{p} + D

    其实直观的理解这个就是阿达姆法则 \frac{W-D}{p} 是可并行化的部分而 D 是不可并行化的。

    所以增速 speed \geq \frac{W_{1}}{\frac{W-D}{p} + D } = \frac{p}{\frac{W-D + pD}{W_{1}}} \

    = \frac{p}{\frac{W}{W_{1}}+\frac{p-1}{W_{1}/D}}

    1. if W= W_1 (work optimality)串行与并行的work是一样的。

    3. 设计并行算法

    那么为了设计并行算法要实现的目标是 Work 与 span 都要小。

    Work efficiency: A parallel algorithm is work efficient if it performs asymptotically the same work as the best known sequential algorithm for that problem.

    需要遵循两条原则

    1. work optimality: w = w1 = O(n) if possible
    2. low span, D(n) = O(log^K{n})

    对于 divide and conquer 的问题的理论上最优是

    T(n) = 2T(\frac{n}{2}) + O(1) = O(n)

    W(n) = 2W(\frac{n}{2}) + O(1) = O(n)

    D(n) = D(\frac{n}{2}) + O(1) = O(logn)

    对于 for 循环

    W_{p}(n) = O(n) D(n) = O(1)

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