美文网首页
plotly--PCA图--在线分析

plotly--PCA图--在线分析

作者: MR来了 | 来源:发表于2021-01-15 13:42 被阅读0次

    这是基于plotly官网的一个例子,在官网的基础上添加了置信椭圆(95%):

    1. 输入输出说明

    • 多维数据,主要用于计算PCA,可以是表达量或者OTU丰度信息。


      pca_data.png
    • 样品分组情况,分为两列,一列是样品,另外一列是分组


      样品.png

    2. 互作图片

    1612219302986.gif
    • 互作图片可以选择是否显示点击legend显示对应内容、置信椭圆、放大放小、是否显示样品名字等,还可以调整置信椭圆等置信区间。

    3. APP说明

    • 背景介绍,主要是介绍方法和出处


      b1.png
    • 输入数据,主要是介绍数据格式


      b2.png
    • 图片互作,可以选择要删除的样品、是否显示样品名字、置信椭圆的取值,值得注意的是:通过点击右上方的legends就可以选择是否显示该对应元素


      b3.png

    4. 在线分析

    链接

    相关文章

      网友评论

          本文标题:plotly--PCA图--在线分析

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/uatwaktx.html