美文网首页
Scanpy一些应用总结

Scanpy一些应用总结

作者: 马疾香幽_0702 | 来源:发表于2022-06-22 10:13 被阅读0次

    1. h5ad文件读取:

    import scanpy as sc

    mdata=sc.read('mdata.h5ad')

    mdata.write_csvs('mdata',skip_data=False)

    如果不设置skip参数的话,不会写出表达矩阵到csv。

    本步骤主要用于h5ad和Seurat格式转换。服务器版本太旧,无法直接转换

    相关文章

      网友评论

          本文标题:Scanpy一些应用总结

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ujgyvrtx.html