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Linux-Ubuntu open-mpi运行错误

Linux-Ubuntu open-mpi运行错误

作者: 了尘兰若 | 来源:发表于2019-03-30 15:07 被阅读0次

    我在win10Linux子系统下使用mpirun多线程运行ABySS基因组拼接软件的时候,出现以下错误提示:

    Linux kernel CMA support was requested via the btl_vader_single_copy_mechanism MCA variable, but CMA support is not available due to restrictive ptrace settings.

    [liaochenlanruo:49950] 4 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib-cpc-base.txt / ibv_create_qp failed

    [liaochenlanruo:49950] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages 

    结果就是无法运行多线程,跑了一夜的程序没有任何动静,似乎是卡死了。Google到的解决方案:

    root用户,终端运行如下命令:

    # echo 0 > /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope

    "ptrace_scope"文件中原来的值为“1”,该成“0”就可以了。

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