1.首先下载好3个文件
image2.按照autodockvina-mgltools-raccoon依次按照到C盘
***autocockvina,和mgl安装可参考以下链接
(https://blog.csdn.net/qq_36170511/article/details/80550517)
(http://blog.sina.com.cn/s/blog_15d0344a30102xfxx.html)
注意,raccoon直接把文件夹解压缩放在到MGLTools的安装目录下
3编辑raccooon.bat文件使得调用的python.exe和raccoon.py指向MGLTools的安装目录下的python.exe和raccoon.py。
image我的安装目录是c:\ProgramFiles(86)\MGLTools-1.5.6,所以编辑.bat文件为"c:\ProgramFiles(86)\MGLTools-1.5.6\python.exe" "c:\ProgramFiles(86)\MGLTools-1.5.6.py"。
1.png.bat文件就是raccoon后面写的Windows批处理。。。,需要右键点击编辑后在文件里修改保存。保存后双击修好的raccoon就可以打开Raccoon.
2.png image
3.png
Raccoon使用
1打开Raccoon
双击Raccoon
2点击图片标黄键 image
3选择需要加载的mol2文件,由于文件大,这一步需要等待3分钟左右
image4打开按照提示操作,点击确定,选择储存的文件夹。
image5这一步在分解小分子
image6开始分解转换小分子结构,从mol2到pdbqt,并存到文件夹中
image7分解完后点击OK进行保存就完成操作了。
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