PanglaoDB可以让用户查询和探索细胞类型、遗传途径和调控网络。它是由瑞典和美国的研究人员共同开发的,致力于探索人类和小鼠的单细胞转录组数据,该数据库的优点是适合零基础的人使用、探索和挖掘,无论你是做人类研究还是小鼠研究,都能用的到。
PanglaoDB is a database for the scientific community interested in exploration of single cell RNA sequencing experiments from mouse and human. We collect and integrate data from multiple studies and present them through a unified framework.
PanglaoDB可以让用户查询和探索细胞类型、遗传途径和调控网络。它是由瑞典和美国的研究人员共同开发的,致力于探索人类和小鼠的单细胞转录组数据,该数据库的优点是适合零基础的人使用、探索和挖掘,无论你是做人类研究还是小鼠研究,都能用的到。
Usage examples
――查看某基因在细胞的表达情况
- Run a gene search for SOX2, PECAM1 or ACE2
——查看数据库中的所有样本 - Browse the full list of samples
——搜索特定细胞的细胞marker - Explore the list of cell type markers for Schwann cells
——查看特定组织的细胞类型 - Browse cell types of the mouse retina
——查看xxxx基因在特定细胞的表达情况 - Look at the expression of CRX in photoreceptor cells
——使用boolean搜索xxxx基因表达的细胞簇 - Find cell clusters where <u style="box-sizing: border-box;">both</u> PECAM1 and VCAM1 are expressed using a boolean search with the 'and' operator
——使用and not搜索 - Find quiescent neural stem cells using AND+NOT
归纳:
1、查看xxxx细胞里的xxxx基因
2、查看xxxx组织里的xxxx细胞亚群
3、查看xxxx细胞亚群的marker
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