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PanglaoDB数据库

PanglaoDB数据库

作者: 不学无数YD | 来源:发表于2021-09-07 23:07 被阅读0次

    PanglaoDB可以让用户查询和探索细胞类型、遗传途径和调控网络。它是由瑞典和美国的研究人员共同开发的,致力于探索人类和小鼠的单细胞转录组数据,该数据库的优点是适合零基础的人使用、探索和挖掘,无论你是做人类研究还是小鼠研究,都能用的到。

    PanglaoDB is a database for the scientific community interested in exploration of single cell RNA sequencing experiments from mouse and human. We collect and integrate data from multiple studies and present them through a unified framework.

    PanglaoDB可以让用户查询和探索细胞类型、遗传途径和调控网络。它是由瑞典和美国的研究人员共同开发的,致力于探索人类和小鼠的单细胞转录组数据,该数据库的优点是适合零基础的人使用、探索和挖掘,无论你是做人类研究还是小鼠研究,都能用的到。


    Usage examples

    ――查看某基因在细胞的表达情况

    • Run a gene search for SOX2, PECAM1 or ACE2
      ——查看数据库中的所有样本
    • Browse the full list of samples
      ——搜索特定细胞的细胞marker
    • Explore the list of cell type markers for Schwann cells
      ——查看特定组织的细胞类型
    • Browse cell types of the mouse retina
      ——查看xxxx基因在特定细胞的表达情况
    • Look at the expression of CRX in photoreceptor cells
      ——使用boolean搜索xxxx基因表达的细胞簇
    • Find cell clusters where <u style="box-sizing: border-box;">both</u> PECAM1 and VCAM1 are expressed using a boolean search with the 'and' operator
      ——使用and not搜索
    • Find quiescent neural stem cells using AND+NOT

    归纳:

    1、查看xxxx细胞里的xxxx基因
    2、查看xxxx组织里的xxxx细胞亚群
    3、查看xxxx细胞亚群的marker

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