为什么用到这个R包:
有一个函数是fastqc
可以指定fastq文件所在的文件夹,指定输出文件夹,指定fastqc软件的安装位置,就可以自动挑选输入文件夹下的所有fastq文件,然后运行fastqc
还可以将单个的fastqc的结果整合到一起
multiqc这个软件也有这个功能
为什么用到这个R包:
有一个函数是fastqc
可以指定fastq文件所在的文件夹,指定输出文件夹,指定fastqc软件的安装位置,就可以自动挑选输入文件夹下的所有fastq文件,然后运行fastqc
还可以将单个的fastqc的结果整合到一起
multiqc这个软件也有这个功能
本文标题:R语言的fastqcr包:R语言里运行fastqc并整合多个fa
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