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R语言的fastqcr包:R语言里运行fastqc并整合多个fa

R语言的fastqcr包:R语言里运行fastqc并整合多个fa

作者: 小明的数据分析笔记本 | 来源:发表于2022-01-30 22:20 被阅读0次

为什么用到这个R包:

有一个函数是fastqc

可以指定fastq文件所在的文件夹,指定输出文件夹,指定fastqc软件的安装位置,就可以自动挑选输入文件夹下的所有fastq文件,然后运行fastqc

还可以将单个的fastqc的结果整合到一起

multiqc这个软件也有这个功能

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