R语言的运行环境

CRAN的R语言环境
集成开发环境Rstudio
Microsoft R Open
基于anaconda/Miniconda构建的R环境

CRAN的R语言环境

官方网站：https://www.r-project.org/

windows下载后，双击安装。

Mac系统自带R，也可以下载安装，和windows类似。

# Ubuntu：
apt-get update
apt-get install r-base r-base-dev
# CentOS
yum install epel-release
yum install R

# 源码编译安装，CentOS7系统测试过，不需要安装依赖
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.5.3.tar.gz
tar zxvf R-3.5.3.tar.gz
cd R-3.5.3
./configure --enable-R-shlib=yes --with-tcltk --prefix=/opt/biosoft/R
make -j 4
sudo make install
# Linux：CentOS 7.5
echo 'export PATH=/opt/biosoft/R:$PATH' >> ~/.bashrc

最好用的R语言IDE--Rstudio

从https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/（Free版即可）下载RStudio Desktop Open Source License
Windows和mac系统安装比较容易。
Linux服务器RStudio Server Open Source License的，需要进行一些网络的设置，安装好后，可以通过服务器ip地址通过网页使用服务器版的RStudio。

Microsoft R Open

https://mran.microsoft.com/download

基于anaconda/Miniconda构建的R环境

软件包下载：
https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html
windwos和mac都是可视化安装，比较简单。
Linux系统下载安装包后，需要使用命令行命令bash安装：

# 注意
bash Anaconda2-5.3.1-Linux-x86_64.sh
# 设置好安装路径，并同意将路径添加到系统PATH中，否则需要自己添加。
# 安装配置好conda后
conda install -y r

如此，可以开始R之旅了！！！

课程分享
生信技能树全球公益巡讲
（https://mp.weixin.qq.com/s/E9ykuIbc-2Ja9HOY0bn_6g）
B站公益74小时生信工程师教学视频合辑
（https://mp.weixin.qq.com/s/IyFK7l_WBAiUgqQi8O7Hxw）
招学徒：
（https://mp.weixin.qq.com/s/KgbilzXnFjbKKunuw7NVfw）