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在jupyter里面运行conda虚拟环境的R

在jupyter里面运行conda虚拟环境的R

作者: 生信编程日常 | 来源:发表于2020-09-28 15:32 被阅读0次

    在想要运行的某个conda环境下特定的R版本
    首先,安装jupyter

    conda install jupyter
    

    打开这个环境下的R,并安装IRkernel

    install.packages('IRkernel')
    

    然后在R的命令行里激活

    IRkernel::installspec()
    

    打开jupyter,此时出现了R的选项,就可以用这个环境下的R了。



    还可以通过jupyter代码框中运行.libPaths()查看是否是想要的R环境。

    .libPaths()
    

    Jupyter 还可以让你在同一个代码框,同时写python代码和R代码的方法——rpy2详情参考:在python中使用R—rpy2包学习

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