1.R
2.Rstudio
http://www.rstudio.com/download
R和Rstudio的安装-搜狗微信搜索
“果子学生信 给自己一个全新的R语言环境” --图文版教程
"生信技能树 史上最贴心R包安装示范视频"--视频版教程
如果Rstudio安装出现问题,很有可能是因为你的用户名是中文的,而Rstudio不能识别中文路径,解决方案:https://www.jianshu.com/p/da9c17d66002
认识Rstudio的界面
3.tidyverse--一个R包合集
R包是函数、数据和文档(documentation)的集合,是对R基础功能的扩展。R包只需安装一次,但每次打开新的session都要重新加载。
session:指的是新打开一个R的工作界面/project。翻译为“会话”
本书中的R包大多数是tidyverse的一部分,ggplot2,tibble,reader,purrr,dplyr被称为tidyr的核心。
#安装tidyverse
install.packages("tidyverse")
# 加载tidyverse
library(tidyverse)
正常的安装结果
如果你对conflicts有疑问,查看书的33页。
我遇到的报错
报错
解决方案:
tidyverse_update()
屏幕提示
The following packages are out of date: ● broom (0.4.4 -> 0.5.0) ● dbplyr (1.2.0 -> 1.2.2) ● hms (0.3 -> 0.4.2) ● purrr (0.2.2 -> 0.2.5) ● reprex (0.1.1 -> 0.2.0) ● rlang (0.2.0 -> 0.2.2) ● stringr (1.3.0 -> 1.3.1) ● xml2 (1.1.1 -> 1.2.0) Start a clean R session then run: install.packages(c("broom", "dbplyr", "hms", "purrr", "reprex", "rlang", "stringr", "xml2"))
根据这个提示重启session,输入上述命令,再次library已经正常。
4.其他R包
学习时用到再安装和加载即可。
微信公众号生信星球同步更新我的文章友情链接:
生信技能树公益视频合辑:学习顺序是linux,r,软件安装,geo,小技巧,ngs组学!
B站链接:https://m.bilibili.com/space/338686099
YouTube链接:https://m.youtube.com/channel/UC67sImqK7V8tSWHMG8azIVA/playlists
生信工程师入门最佳指南:https://mp.weixin.qq.com/s/vaX4ttaLIa19MefD86WfUA
学徒培养:https://mp.weixin.qq.com/s/3jw3_PgZXYd7FomxEMxFmw
网友评论