美文网首页R语言学统计【医学统计学 第四版】
第十一章 多因素试验资料的方差分析

第十一章 多因素试验资料的方差分析

作者: x2yline | 来源:发表于2017-10-30 19:07 被阅读55次

第十一章 多因素试验资料的方差分析

x2yline
r Sys.Date()

知识清单

    1. 析因资料的方差分析
    • 几个基本概念
    • 基本分析思路
    • R语言实现
    1. 正交设计与方差分析
    1. 嵌套设计资料的方差分析
    1. 裂区设计资料的方差分析

1. 析因资料的方差分析

1.1 基本概念

多个因素多个水平的全面交叉分为处理组,2因素2水平是至少每一组合至少重复2次

以下表为例:

  b1 b2
a1 24 44
a2 28 52
  • 单独效应(simple effect):其他因素固定时,同一因素不同水平间的差别,如A固定在a1水平的时候B因素的单独效应为a1b2-a1b1=20
  • 主效应(main effect):指某一因素各水平间的平均差别,如A因素的主效应为((a2b1-a1b1)+(a2b2-a1b2))/2=(4+8)/2=6
  • 交互作用(interaction):当某因素的各个单独效应随另一个因素变化而变化时,则称这两个因素间存在交互作用。A与B的交互作用表示为AB(A是否随B的变化而变化,AB=[(a2b2-a1b2)-(a2b1-a1b1)]/2=(8-4)=2

主效应和交互作用的区别就是加减号不同

1.2 基本思路

变异分解的思路

总变异分解为处理组间变异误差,处理组间变异继续分解为主效应交互作用

交互作用通常通过处理组间变异和主效应做差求得

自由度:
g=IJK个处理组,每组例数为n则总变异自由度为gn-1,A主效应自由度为I-1,B主效应自由度为J-1,C主效应自由度为K-1,AB的自由度为(I-1)(K-1)···,ABC的自由度为(I-1)(J-1)(K-1),误差的自由度为为g(n-1)也等于总自由度减去其余分解出来的自由度。

1.3 R语言实现

与前面的拉丁方分析一样【有一点不同是拉丁方没有考虑个因素直接的交互作用而使用aov(y~a+b+c),考虑交互作用则用aov(y~a*b*c),用aov函数按不同因素进行分解即可,如例11-3的数据:

data1 <- haven::read_sav(
  "E:/医学统计学(第4版)/各章例题SPSS数据文件/例11-03.sav")
# x是热感觉评分,a是军装类型,b是环境,c是活动状态
# 都应该转为factor否则会默认是数值而不是分组标识
data1$a <- factor(data1$a)
data1$b <- factor(data1$b)
data1$c <- factor(data1$c)
head(data1)
## # A tibble: 6 x 4
##       x      a      b      c
##   <dbl> <fctr> <fctr> <fctr>
## 1  0.25      1      1      1
## 2 -0.25      1      1      1
## 3  1.25      1      1      1
## 4 -0.75      1      1      1
## 5  0.40      1      1      1
## 6  0.30      2      1      1
summary(aov(x~a*b*c, data=data1))
##             Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
## a            4   5.21    1.30   3.032   0.0221 *  
## b            1   9.92    9.92  23.083 7.13e-06 ***
## c            1 283.32  283.32 659.096  < 2e-16 ***
## a:b          4   1.95    0.49   1.132   0.3472    
## a:c          4   1.48    0.37   0.862   0.4908    
## b:c          1  12.69   12.69  29.517 5.82e-07 ***
## a:b:c        4   1.61    0.40   0.935   0.4479    
## Residuals   80  34.39    0.43                     
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 2 observations deleted due to missingness

结果与教材上的一致,结论为不同军装,不同环境和不同活动状态的主观热感觉都有差别,但尚不能认为军装与其他两个因素存在交互作用(b,c)。

2. 正交设计与方差分析

相关文章

  • 第十一章 多因素试验资料的方差分析

    第十一章 多因素试验资料的方差分析 x2yliner Sys.Date() 知识清单 析因资料的方差分析几个基本概...

  • 【Excel系列】Excel数据分析:方差分析

    单因素方差分析 12.1 单因素方差分析基本理论 (1)单因素方差分析的概念 单因素方差分析,是指对单因素试验结果...

  • 方差分析

    方差分析 概念 试验指标:要考察的指标 因素:影响试验指标的条件,分为可控因素和不可控因素 因素的水平:因素所处的...

  • D24 2019-10-21方差分析之双因素无交互分析举例

    前两天说的是单因素的方差分析,双因素的方差分析无重复测试,这样的结果只能是无交互作用的试验设计。若再试验设计...

  • 《实验设计与建模》方开泰.版学习笔记-思维导图-第2章

    第二章 因子试验设计2.1 单因素试验 2.1.1 线性可加模型 2.1.2 方差分析 2.1.3 多重比较 2....

  • 方差分析

    方差分析用于两个及两个以上样本均值差别的显著性检验,方差分析分为单因素方差分析和多因素方差分析。在进行方差分析时,...

  • 微生物组学差异性检验

    1. Adonis vegan包置换多因素方差分析(非参数多因素方差分析),可对OTU矩阵及所有环境因子矩阵进行差...

  • 2019-10-18

    今天是21天的分享,这是单因素方差分析。分析这个因素是否是显著性影响,是否与试验因素有显著性差异,我们所考虑的单因...

  • ggplot2优雅的创建字母显著性标记图

    本节来介绍如何使用R做单因素与多因素方差分析,并添加显著性字母标记,下面通过2个小栗子来进行展示 单因素方差分析 ...

  • 假设检验-方差分析

    例子-完全随机设计资料方差分析(单因素方差分析) 例子-随机区组设计 误差自由度=(处理组数-1)x(区组数-1)...

网友评论

    本文标题:第十一章 多因素试验资料的方差分析

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/uvsmpxtx.html