参考:https://www.plob.org/article/655.html

gff文件格式与gft文件格式：

GFF： General Feature Formate， 每行代表一个feature，每个文件有9列组成。
GTF：General Transfer Formate，是第二代的GFF。

gff是文本文件，由tab键隔开的9列组成，以下是各列的说明：
Column 1: “seqid/seqname”
序列的编号，编号的有效字符[a-zA-Z0-9.:^*$@!+_?-|]
Column 2: “source”
注释信息的来源，比如”Genescan”、”Genbank” 等，可以为空，为空用”.”点号代替
Column 3: “type/ feature”
注释信息的类型，比如Gene、cDNA、mRNA等，或者是SO对应的编号
Columns 4 & 5: “start” and “end”
开始与结束的位置，注意计数是从1开始的。结束位置不能大于序列的长度
Column 6: “score”
得分，数字，是注释信息可能性的说明，可以是序列相似性比对时的E-values值或者基因预测是的P-values值。”.”表示为空。A floating point value.
Column 7: “strand”
序列的方向， +表示正义链, -反义链 , ? 表示未知.
Column 8: “phase/ frame”
仅对注释类型为 “CDS”有效，表示起始编码的位置，有效值为0、1、2。 '0' indicates that the first base of the feature is the first base of a codon, '1' that the second base is the first base of a codon, and so on..
Column 9: “attributes”
以多个键值对组成的注释信息描述，键与值之间用”=“，不同的键值用”;“隔开，一个键可以有多个值，不同值用”,“分割。注意如果描述中包括tab键以及”,=;”，要用URL转义规则进行转义，如tab键用 %09代替。键是区分大小写的，以大写字母开头的键是预先定义好的，在后面可能被其他注释信息所调用。