Q20：质量值为20，表示错误率为1/100，正确率99%
Q30：质量值为30，表示错误率为1/1000，正确率为99.9%
phix:
扩增子测序，质量控制出现下面的情况，推测原因：
2e119b694218a23e6526cf5d434a5d2.png
1.测序过程中，液路系统进了气泡，核实办法，去看原始的照相图片，如果图像上有大片的白光，那说明是气泡问题；
- 就是你们测序的对象，是个碱基超级不平衡的样品，而且测序过程中没掺入phix进行碱基平衡。
目前的解决方案是：
在测低复杂度的文库时，掺入一定量的高复杂度文库。最常用的掺入文库是Illumina出品的PhiX文库，也有些实验室会用哺乳类动物的基因组文库来增加文库的复杂度，效果是一样的。
PhiX文库有以下的特点：
PhiX文库中GC含量约为45%，是碱基比例较为平衡的样本。
PhiX DNA就是ΦX174噬菌体的DNA，其基因组的长度是4kb略多，其序列已清楚地被测定。
PhiX DNA文库没有Index，所以在样本Demultiplex的过程中，被挪到undetermined的文件中，不会与别的有Index的文库相混。
PhiX的序列是已知的，所以，在测序过程中，仪器会对PhiX的序列进行比对，算出Phasing和Pre-Phasing(一个簇中，有多少比例的DNA是少合成了一个碱基（Phasing），又有多少比例的DNA是多合成了一个碱基（Pre-Phasing）
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