刘小泽写于19.10.10上一次介绍了使用Seurat 的merge函数来合并4个样本（各有2个生物学重复）的8组...
刘小泽写于19.10.10作者：刘小泽链接：https://www.jianshu.com/p/e639cc257...
一. 研究背景 使用不同技术生成的大规模单细胞转录组dataset，批次效应特殊的系统变化对批次效应效果的去除和d...
我需要把多个数据集的数据合到一起怎么办？直接inner_join()或者cbind()就可以拿来用吗？当然不行！进...
前面也说过用CCA，SCTransform和Harmony等可以消除多个数据的批次效应，来实现多组数据的整合。但有...
关于sva包 sva的用户说明：http://www.bioconductor.org/packages/rele...
CCA 需要很大的内存，我开到了64+512仍然卒，可能我的数据量比较大，但理解过后，还是奉上代码，还有友情提示，...
cluster 不同聚类方法比较 normmlization，去除一些批次效应等外部因素。通过对表达矩阵的矩阵的聚...
如何处理批次效应？ 搞定TCGA批次效应！?-sci666
batch effect（批次效应） 在高通量研究中，常常被忽略的一个问题就是批次效应，简单的说，批次效应就是由实...
本文标题：scRNA-使用sctransform去除批次效应
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/vddeaktx.html
网友评论