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文献阅读:Single-cell multiomics sequ

文献阅读:Single-cell multiomics sequ

作者: liu_ll | 来源:发表于2018-12-16 22:34 被阅读98次
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    这篇文章由他们之前实验室的Tribio-seq1.0到2.0,由RRBS 变成了 WGBS

    文章总结:
    1、基于DNA甲基化组数据推断出的基因组拷贝数变异精准鉴定了肿瘤细胞的亚克隆。这些亚克隆与肿瘤的发生发展密切相关,发现原发位肿瘤的亚克隆结构通常比转移位肿瘤更复杂。
    2、系统解析了肿瘤细胞DNA甲基化遗传谱系高度一致,不同谱系之间和同一谱系不同亚克隆之间的DNA甲基化差异明显。基因启动子区域的DNA甲基化与相应基因的表达呈现的负相关,而基因区的DNA甲基化与相应基因的表达呈现正相关。
    3、在癌细胞中,他们发现DNA低甲基化主要集中在长末端重复序列,长散在重复序列和异染色质区域,而DNA高甲基化集中在CpG岛和开放染色质。
    4、揭示了结直肠癌细胞染色体水平的DNA甲基化异常和染色体的不稳定性之间的关系,高频的染色体异常往往去甲基化水平越高。

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