环状RNA (circRNA) 是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子，对多种细胞活动和多种人类疾病至关重要。既往研究中已经在双链DNA病毒(dsDNA)中鉴定了几种与癌症相关的病毒circRNA，但关于病毒circRNA的系统研究尚未见报道。VirusCircBase是第一个病毒circRNA数据库，可以为研究者们提供探索和研究病毒circRNA的基础图谱。
该数据库可访问地址：http://www.computationalbiology.cn/ViruscircBase/home.html
该数据库对来自23个病毒物种的11 924个circRNA进行了系统调查，其中包括双链DNA病毒、单链RNA病毒和逆转录病毒中的大量circRNA。研究思路：①获得病毒感染的RNA-seq数据集；②用三种计算方法（circRNA_finder、find_circ和CIRI2）识别病毒环状RNA；③对病毒环状RNA进行注释和表征；④建立VirusCircBase数据库，用来存储和组织病毒环状RNA。
研究结果发现大多数病毒circRNA在反向剪接位点的侧翼序列具有反向互补序列或重复序列，大多数病毒circRNA仅在特定物种的特定细胞系或组织中表达。功能富集分析表明，来自dsDNA病毒的病毒circRNA参与了与癌症相关的KEGG通路。
VirusCircBase页面主要包括：统计，浏览，搜索，miRNA，下载及帮助。
统计：该页面展示了每种病毒中病毒环状RNA的统计汇总，包括病毒环状RNA的长度和丰度，以及不同方法检测到的病毒环状RNA数量；
浏览：该页面按病毒种类、科和类群显示病毒环状RNA，对于每个病毒环状RNA，页面默认显示病毒环状RNA的位置、丰度、包含的基因、检测方法、检测到病毒环状RNA的细胞系或组织等。更多关于病毒环状RNA的信息，如使用的基因组的登录号和NCBI SRA数据库中的样本，也可以通过选择显示出来;
搜索：用户可以通过病毒宿主、细胞系或组织、病毒、包含的基因、位置、检测方法和丰度来搜索感兴趣的病毒环状RNA；
MicroRNA：预测了病毒环状RNA和所有宿主miRNAs之间的相互作用。对于每个病毒环状RNA，其宿主miRNA与其相互作用，其miRNA的结合位点和相互作用概率在页面中显示。用户可以通过搜索环状RNA或miRNA的名称，快速发现病毒环状RNA与宿主miRNA之间的相互作用；
下载：可以免费下载所有的病毒环状RNA，包括病毒环状RNA序列和详细的信息，以及它们与宿主miRNAs的相互作用。
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