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开展基因家族分析 与 我的一点看法

开展基因家族分析 与 我的一点看法

作者: 生信石头 | 来源:发表于2018-07-28 20:21 被阅读409次

    写在前面

    写这篇文章,我主要是聊聊我个人对于最近基因家族分析培训热的一些想法
    文末推一个《0.01元的基因家族分析网络视频教程》,原价 200RMB哈

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    基因家族分析是什么?为什么要做基因家族分析?

    植物大多数都经历了全基因组复制,大片段复制等进化事件,所以大多数基因均是以基因家族的形式存在。这些基因家族有小有大,少的可能是2个,多的可以到数百个,而这些基因,其实都来自于同一个祖先基因。在长时间的进化过程中,来源于相同祖先基因即同一基因家族的不同成员序列也变得不同,而各自的功能也变得有所不同。可能有的成员与抗逆有关,有的与开花有关,有的与着色有关。而做植物学研究的朋友,往往有各自关注的生物学过程或者分子功能,快速在目标物种中确定与目标性状有关的基因家族成员将有助于缩小研究范围,节省实验成本。
    当然,基因家族分析不仅仅有这个用处,其还可能用于:

    1.确定当前物种是否有特有的基因家族分支,这个可能对应了该物种特有的分子生物学过程
    2.确定当前物种是否在某个特定的基因家族分支得到扩展,这个也可能对应了该物种强化的分子生物学功能,如桉树的MYB
    3.了解基因的进化历史,高档次的基因家族分析,会涉及到进化尺度上的基因家族分析,厘清其进化历史,可以为遗传操作提供参考

    1. 可能也是相对多数人做基因家族分析的原因,即发表SCI论文

    大多数刚发表植物基因组文章的课题组或单位,会对该物种的多个基因家族进行分析并发表学术论文,而这似乎总是会被人误解为灌水。其实不然,存在很多工作者,本身就是对这个家族比较熟悉,厘清其成员分类,主要目的是为接下来的工作打基础。

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    那么,基因家族分析,就能发表SCI论文了?

    肯定不是。这跟大多人一样,实验做得好,文章一样少。分析与实验是完全相同的,我相信,大多数人即使掌握了基因家族分析(其实一般是基础的基因家族分析),那么也发不了文章。当然,这需要一个过程。而第一步,确实是先分析再说。
    正好,当前高通量测序如PCR技术一般普及。大量植物基因组得以发布,为大多数人提供了基因家族分析的数据基础。对于如何进行基因家族分析,我之前推过一篇文章,几乎是纯windows下进行基因家族分析。感兴趣的朋友不会太少。而在同时或者之后,出现了不少培训或者网络课程。相信这个确实在一定程度上对大家有所帮助,只是一般他们培训什么?

    基因家族分析的培训是什么?

    套路。其实能拿出来培训的,也基本是套路。而套路也往往就是基础的基因家族分析,其主要包括内容应是:

    1.确定基因家族成员
    2.对基因家族成员进行序列特征分析
    3.基础的进化分析
    4.有必要就功能分析提供
    5.表达验证
    ...

    很早的时候,我也推过一个图文教程,
    零基础-6小时-完全重现某个基因家族分析文章的(分析部分)
    基本跑不了这些。然而,可能就是这样,也常常会让大多数没接触过的人觉得很困难,所以这些培训存在总是合理的。

    基因家族分析业务,值不值3w?

    曾经有一个公众号A对外开价,基因家族分析服务费,是3w人民币,这个到底值不值,
    考虑到这类科研服务的绝对个性化,我觉得很值
    每个人的时间都是有限的,要实现梦想,要么花时间,要么买时间,而时间很贵。
    分析服务很贵,那么基因家族培训也类似,
    最近又另一个公众号B对外开价,线下培训2K~3K,大概两三天,还是比较良心的(不过他们一样不按规则出牌,用了TBtools在收费培训中,却并没有获得我的同意)。同时找了另一个公众号C,帮忙做了广告文。
    都好吧,线下培训往往比线上培训贵。

    基因家族分析培训值不值398?98?200?

    比较早的时候,我们会发现有一些在线的基因家族分析课程,多数是在网易云上,目前看来至少有三家在卖,
    一个报价398
    一个报价98
    值还是不值,只能说都值,
    但是他们还是用了TBtools而并没有告知我
    我并没有说过要干啥,只是我至少不能用自己的时间去回复他们培训带来的用户各类问题,亦即我的时间为他们实现商业化梦想,这对我个人并不公平。

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    推一个《一分钱的基因家族分析网络视频教程》

    今天,有一个公众号,一开始推了200块钱的课程,而后续在我一番吐槽后,其修改价格为0.01RMB。
    其实,这并不是我的本意,我认为每个人的相应付出都应该得到相应回报。
    当然其在与我取得沟通前,先行修改为接近免费,那么这波操作,我只能说厉害
    因为,既然是免费,那么就跟我推TBtools的想法是类似的。反而,我会觉得录制视频的朋友有点亏,哈哈。
    为了感谢其付出,我在此推一下该课程
    一分钱的基因家族分析视频
    我已与该公众号运营者确定了情况,该课程永久免费

    写在最后

    我一直有一个最小的坚持,我只卖我拿得出手的东西,所以我注定做不了商人。然而,我是一个俗人,并不排斥商业化。
    该公众号最终将课程直接调整为免费,这个的原因有很多,我个人也有不妥当的操作,我们都还是太年轻。
    对于商业运作相关的事情,最近我已经一错再错了,连错三次了,希望自己能变得成熟。
    最后,谢谢大家的支持。

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      网友评论

      • 999d5d28fb22:请问在哪儿可以学习这个1分钱的基因家族分析课程?
        生信石头:@月半弯_ed8e 似乎他家觉得太亏了,所以关起门来卖了。等以后有时间我再去找事

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