他来了，他来了，万众瞩目的《蜘蛛侠-英雄无归》，终于在国内上映了。
开篇则是完美衔接上一部剧情，神秘客在临终之前曝光了蜘蛛侠的真实身份，他就是17岁的高中生-彼得.帕克。
然而，身份被曝光以后，周边的人对他产生了两极分化的态度，大多数人们对这位高中生，以及身边的朋友，家人都产生了强烈的好奇。
还有一部分人把他列为杀人犯，不惜加以诋毁和谩骂，舆论新闻更是为了流量把蜘蛛侠称为纽约市的威胁，事情严重影响了彼得帕克的正常生活。
联邦探员更是将蜘蛛侠以及周边相关的人，带去审问，他们误认为，是蜘蛛侠利用无人机杀了神秘客，他应该为此付出代价。
好在蜘蛛侠和他的朋友们统一口径，并且，请了一位律师为自己辩护，律师告诉他们，现在没有任何证据证明蜘蛛侠亲手杀害了神秘客，所以，他们逃离了法律的制裁。
但是，另一个难题就是，他即将面临舆论给他带来的负面的棘手问题，就在他们讨论的时候，窗外的极端群众向屋内扔了一块“我们需要一个更安全的环境"砖头，被律师敏捷的拦下，避免了对屋内人的伤害。
这里的律师，其实是夜魔侠，这也难怪他的身手连蜘蛛侠都感叹，你是如何做到的？
话分两头，蜘蛛侠回到了学校以后，他面临的下一个棘手的问题就是，他和mj ，奈德的大学入学麻省理工的申请，因为舆论的压力，都被屡次驳回，导致他们极度无奈，因为自己是蜘蛛侠，不但自己受到不公正的待遇，就连身边的人，也被牵连，悲伤之余，彼得帕克，想到了奇异博士。
他找到奇异博士，想让奇异博士利用时空回溯，抹去神秘客的所作所为，可奇异博士告诉他，为了复活，他们已经篡改了时空的稳定性，那可是无数人的生命，就因为蜘蛛侠的生活被打乱了，他们却要重蹈覆辙吗？
显然这是奇异博士无法接受的，况且，就算奇异博士想帮助他，现在也没有时间宝石了。
就当蜘蛛侠表示无奈之时，奇异博士想到了可以用咒语实现让人们忘掉蜘蛛侠就是彼得帕克，但是，王 提醒他，这个咒语穿梭于已知与未知的现实之间的黑暗边界，太危险了，但是，奇异博士看到蜘蛛侠如此遭遇，还是决心想帮助他一次。
就在奇异博士施法之时，蜘蛛侠的碎嘴的模式又开始了，他想把mj剔除，因为他不想失去这个花了很多钱和精力的女友，毕竟这年头，找个女朋友不容易。
奇异博士虽然觉得无语，但是还是翻了个白眼，帮助蜘蛛侠取消了mj、对蜘蛛侠就是彼得帕克的忘记。
但是，彼得又得寸进尺，他又想留下奈德和梅姨以及哈皮的记忆，导致施法错乱，咒语失控，奇异博士很生气，告诉彼得，可以去找校方谈谈，这是彼得应该收要去做的事情。
彼得给闪电打电话通过答应闪电可以用蛛丝送他上学和告诉其他人，闪电是蜘蛛侠的好朋友来换取校方负责招生的副校长助理的信息，还告诉他，校长助理即将去机场离开，蜘蛛侠知道后，赶紧紧随其后，希望可以和她谈谈入校的事情。
彼得找到副校长助理后，正在讨论的过程中，彼得感应到有危险降至这里。
原来是托比版蜘蛛侠中的反派，章鱼博士正在摧毁路面上的汽车，蜘蛛侠赶紧穿好战衣，准备迎敌。
章鱼博士看到荷兰第版蜘蛛侠以为是自己世界的彼得帕克，上去就是一顿疯狂攻击，在两人打斗过程中，章鱼博士损坏了蜘蛛侠纳米战衣，并且吸收在了自己章鱼手臂上，顺便做了个武器升级。
但是，没想到，反被蜘蛛侠控制，蜘蛛侠通过对战衣的控制，成功解救了麻省理工的副校长助理，这也让她决定试着替彼得和他的朋友们跟学校说一下，看看能否重新考虑一下录取他们的事情。
安全解救了副校长助理以后，路面上有人扔绿色的南瓜炸弹，又炸毁了部分路面设施以及汽车，原来是绿魔奥斯本闪亮登场，旁边的章鱼博士不敢相信这是真的，因为，在他的世界，奥斯本早已经死了。
就在这时，奇异博士通过魔法，将现场的章鱼博士和蜘蛛侠传送到了自己这里，并且把章鱼博士关在了一个透明的地牢里。
蜘蛛侠问他:“这是怎么回事，为什么会有这些人的出现？”
奇异博士告诉他，因为彼得打乱了个忘记蜘蛛侠是彼得帕克的咒语，导致所有跟蜘蛛侠有关的其他世界的人，都拖了进来，也就是多元宇宙，虽然他控制住了那个咒语的破裂，但是还是有一些漏网之鱼。
在彼得从自己这里走后，他就感受到了其他宇宙的来访者，所以，他在下水道里，发现了蜥蜴博士，并将其关了起来。
听到这里，蜘蛛侠说，在大桥上，他还看到过绿魔，奇异博士告诉他，接下来，希望蜘蛛侠能够把所有这些平行宇宙的外来访客都带到他这里，他想办法把他们统一送回去他们自己的世界。
蜘蛛侠答应了，但是，他需要奈德和mj给他一点帮助，奈德和mj来到奇异博士这里以后，奈德对这里的一切非常感兴趣，并跟奇异博士讲，自己的奶奶说自己可以在手上变出点叮铃铃的东西，奇异博士无奈的告诉他，你该看神经科医生，你那是手脚痉挛。
mj和奈德见到蜘蛛侠以后，他们知道了因为彼得的扰乱，奇异博士咒语错乱，导致多元宇宙的其他人都来到了现在这个世界，为了解决这档子事，奇异博士安排他们在地下室工作，蜘蛛侠因为战衣被人泼了绿色液体，无法清洗，只能反过来穿，也就是黑金战衣，然后去寻找其他反派，奈德和mj则是远程通过定位和远程监控帮助蜘蛛侠。
到了晚上，在一个树林里，蜘蛛侠发现了电光人，电光人对蜘蛛侠进行了攻击，把他胸前的定位系统和远程监控视频给损坏了，至此，奈德和mj 与蜘蛛侠失去了联系。
与此同时，沙人也出现了，他以为眼前的蜘蛛侠是自己世界的彼得帕克，彼得告诉他，自己是平行宇宙的彼得，沙人懵懵懂懂不知道他说的什么意思，彼得也说稍后再解释，希望沙人能帮助他阻止眼前这个电光人，沙人同意了，随后两人一起行动打断了电光人的充电，彼得随后把电光人和沙人传送回了奇异博士的地牢。
这边蜘蛛侠还在寻找其他人的时候，梅姨来电话说，绿魔竟然在梅姨的工作那里，蜘蛛侠急忙赶到梅姨那里，发现绿魔变成常态普通人，在跟梅姨诉说自己有时候被绿魔控制，没办法做自己，仿佛一个受害者。
随后，蜘蛛侠把他带回到了奇异博士下室后，奇异博士想用梅山帝之盒将所有人传送回属于他们自己的世界。
但此时，蜘蛛侠却夺想走梅山帝之盒，不想让他们回到自己的世界等死，但是，奇异博士显然不会同意，因为，这些人都有自己的宿命。
但是，蜘蛛侠却一心想要救赎这些反派，在争斗过后，将奇异博士控制在了镜像空间里，自己带着梅山帝之盒和环戒，回到了地下室，跟所有的反派讲，他会尽自己所能，救赎他们。
所有反派跟着彼得回到了哈皮家里，彼得展示了托尼钢铁侠留下的高科技设备，电光人看到那个胸前反应堆，感受到了前所未有的能量，心里却想着占为己有，做更多的事情，在蜘蛛侠的努力下，竟然真的把损坏的章鱼博士颈后的芯片拆卸了下来，章鱼博士也恢复了正常。
正当蜘蛛侠要继续拯救其他反派的时候，绿魔却不再配合，导致所有反派在其蛊惑下，都选择了放弃治疗，电光人更是抢走了反应堆，绿魔更是打斗过程中杀害了梅姨，蜘蛛侠眼看着自己的怜悯之心，换来的却是自己最亲的梅姨之死。心里无比懊悔，梅姨也在临终之前对着蜘蛛侠说到那句经典的话：能力越大，责任越大。
在另一头，奈德和mj在等彼得的时候，奈德戴着奇异博士的环戒，无意中却打开了传送门，让人激动人心的一刻发生了，是平行宇宙的加菲版的超凡蜘蛛侠走了出来。
然而，奈德又试了一次打开传送门，托比蜘蛛侠也走了出来，至此，三虫都已聚齐，看到这一幕，相信很多蜘蛛粉这一刻有多感动。
随后，他们想尽快找到荷兰第版蜘蛛侠，因为，加菲和托比都感受到，荷兰第蜘蛛侠需要他们的帮助，两代蜘蛛侠想到荷兰第肯定在一个远离喧嚣的地方，在独自伤悲。
随后几人终于找到了荷兰弟蜘蛛侠，荷兰第看到两位前辈，觉得他们本应该不属于这里，都是因为自己的失败把他们卷入进来。
两位前辈，更是简述自己的经历，原来，在他们不同的平行世界里，都是去过自己至亲，也都曾被那句：能力越大，责任越大，鼓舞着，托比蜘蛛侠告诉荷兰第说到，也许，梅姨的死对于荷兰第蜘蛛侠来说，并不是毫无意义。
随后，三代蜘蛛修回到了实验室，一起准备合力研制拯救那几位反派的试剂。
这期间，奈德问托比版蜘蛛侠，在他的世界，有没有像奈德这样的好朋友？托比说，他有一非常好的朋友，最后死在了托比的怀里。
奈德听完后，吓出一身冷汗。荷兰第蜘蛛侠让他做个诊断报告，奈德也是搞笑的做完，赶紧远离荷兰第蜘蛛侠，这一幕，让刚刚悲伤的氛围一下子又有了几分搞笑。
这时，奈德叫了一声彼得，却三人都做了回应，这一幕，莫名的神奇。
准备好一切时，奈德递给了荷兰第他的蛛网液体，托比很是疑问，问为什么要用这个？随后展示了体内发丝的绝招，两个后辈看得目瞪口呆，简直不可思议。
随后，他们整装待发，荷兰第蜘蛛侠通过媒体向几个反派通告，准备最终的决战，地点在自由女神像，加菲在准备前期还帮忙治好了托比的背部，这个细节，相信看过托比版蜘蛛侠的都知道这个梗，漫威也算是太细节了。
同时，加菲和荷兰第蜘蛛侠，问托比，从体内射出蛛丝，是什么感觉？非常好奇，托比说，他也不清楚，类似于呼吸，不是可以去做的，顺其自然而来。
他们还讨论都遇到过什么样印象深刻的反派？托比说，他遇到过一个外星黑色的液体，那就是毒液，荷兰第则是说外星反派灭霸，加菲则是说，他遇到的就逊色很多，只是一个遇到过一个驾驶着巨型犀牛机甲的俄罗斯人。
然而，过了一会，三代蜘蛛侠，都感应到了反派的到来，荷兰第蜘蛛侠把梅山帝之盒，抛给了打开传送门的mj和奈德，但是，奈德学艺不精，只能打开传送门，却关不上。
再看三代蜘蛛侠不会互相配合，他们平时都是单打独斗，但是荷兰第却说，他曾经参加过复仇者联盟，有一点经验，托比和加菲不知道什么是复仇者联盟，以为是乐队，荷兰第也是无奈至极。但是在荷兰第的建议下，他们决定分工行动，分成了123号，逐一完成任务。
期间章鱼博士也帮助了蜘蛛侠们，摘掉了电光人的反应堆，将其治愈，成功洗白。
奈德更是又打开了一个传送门，里面走出的确是奇异博士，他收回了环戒和梅山帝之盒，奈德告诉奇异博士，彼得正在实施可行的计划，已经治愈了部分反派。奇异博士表示很惊讶，没想到蜘蛛侠真的做到了。同时也惊讶，奈德竟然可以打开传送门。
奇异博士看到三个蜘蛛侠，在惊讶之余，也觉得应该快点结束这一切了。
这时，绿魔来了，将梅山帝之盒抢走，但是，被抢回来之时，里面塞了个南瓜炸弹。炸弹炸毁了建筑，mj失去平衡掉了下去，荷兰第去营救的时候，却被绿魔的滑翔机撞飞，这时，加菲版蜘蛛侠立马去接，有了格温的教训，加菲没有选择用蜘蛛丝去网住mj，而是直接双手去抱住，当接到mj的时候，感同身受，双眼湿润，这一次，他接住了。
荷兰第蜘蛛侠这边则是和绿魔激战之后，占得了上风，当准备杀死绿魔解心头之恨的时候，托比蜘蛛侠阻拦了他，希望他不要把仇恨记得太深，但是，绿魔不讲武德，偷袭了托比蜘蛛侠，并且开始嘴欠模式，此时，加菲蜘蛛侠扔给荷兰第蜘蛛侠药剂，随即注射给了绿魔。绿魔也得以救赎。
与此同时，奇异博士告诉荷兰第，平行宇宙还有人在过来，所有知道蜘蛛侠的人都要来找蜘蛛侠，他已经快控制不住了，荷兰第请求奇异博士，再施咒语，让这个世界所有人忘记蜘蛛侠彼得帕克的存在，这一次，他不在除去任何人了，奇异博士考虑再三，还是只能接受蜘蛛侠的建议，给了他们告别的最后时间。
荷兰第蜘蛛侠和托比，加菲道别之后，就去和mj和奈德道别，彼得告诉他们，他会去找他们，努力让他们想起他的存在。
咒语成功以后，世界恢复了平静。
彼得拿到入学通知书后，来到mj打工的店里找他们，得知mj和奈德都已经成功考入麻省理工，心里非常的开心，但是，彼得刚要和mj讲述自己的事情的时候，他俩看到mj眉间的创可贴还在，他觉得，mj和他在一起，只会危险不断，所以，默默的选择了离开。
彼得去梅姨坟前祭奠的时候，哈皮也去了，但是哈皮只记得蜘蛛侠，但是，也忘记了蜘蛛侠就是彼得，彼得最后搬到了新家，开始了新的生活。电影的结尾，彼得穿起了新的战衣，继续做起了，友好邻居-蜘蛛侠。
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