相对于传统的Chromium Controller,Chromium X具有更高的细胞通量和更广泛的用途,可以绘制更精密的细胞图谱,发现稀有细胞类型,可适用于Fixed RNA(固定RNA),更好的助力单细胞科研研究,解决冻存细胞样本、脆弱样本、珍贵样本研究困难等问题,该平台还可与Chromium Controller平台的芯片兼容,是高通量的全能单细胞利器。话不多说,下面小编带您来了解一下Chromium X平台具体情况。
Chromium X平台介绍
Chromium X(简称X平台)可以在一次运行中分析数百到数十万细胞,实现更多细胞的检测,是目前10x genomics推出的最高通量的仪器。X平台与10x单细胞转录组、单细胞免疫组库(VDJ)、单细胞ATAC、单细胞多组学ATAC+GEX等多种应用兼容。
那么X平台具体能做什么?
实现高通量捕获
X平台对比Chromium Controller有更高的通量:
X平台芯片有16个通道,而Chromium Controller仅有8个通道
X平台单通道细胞捕获量提升至2万,每10000个细胞双胞率仅4%;而Chromium
Controller单通道最多捕获1万细胞;每10000个细胞双胞率8%
X平台的单通道细胞捕获量升级了一倍,双细胞率降低了一倍;X平台相比传统的Chromium Controller细胞通量变高了,同时数据质量也得到了更好的提升。X平台实现了百万级别的单细胞测序,高通量细胞捕获有助于发现稀有细胞类型,绘制更加精细的细胞图谱,推进高通量药物筛选,患者队列研究,CRISPR筛选等大规模单细胞测序实验。
适用于Fixed RNA
1.什么是Fixed RNA
单细胞Fixed RNA为10x Genomics于2022年3月推出的新产品,采用4%的多聚甲醛(PFA)对细胞进行固定,锁定RNA的表达状态,建库时通过探针杂交捕获基因,可覆盖18,000多个基因,解决了单细胞样本储存、多样本批量处理以及混样测序的问题,让单细胞转录组的研究更加灵活。
2.Fixed RNA对单细胞研究优势
保留脆弱细胞或动态的生物学状态
将分析扩展到更多样本
样本固定后集中处理,在同一次运行中批量操作实验和分析,最大限度减少实验可变性和批次效应
单通道中最多可混16个样品,每个样本捕获8,000-10,000细胞,单张芯片最多可混128个样本,最多可得1,024,000个细胞,混样大大降低实验成本
3.Fixed RNA固定样本时间
Fixed RNA固定后的样本在4℃可储存一周;在-20℃/-80℃最多可储存3个月;
4.Fixed RNA技术仅适用于X平台,Fixed RNA固定解决了用于一定时间的储存和运输样本问题,而不影响细胞组分和RNA的表达状态,打破脆弱样本、珍贵样本的限制,为单细胞转录组的研究提供了便利。
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