中国基因检测市场可分为三大业务板块:科研业务、临床业务和消费级业务。其中,临床业务作为基因检测业务的核心板块,主要应用在肿瘤诊断、遗传病检测和产前诊断中。肿瘤基因检测是精准医疗的基石,基因检测的结果主要用于临床用药参考与用药指导。
基因检测技术主要可分为PCR技术(聚合酶链式反应)、免疫荧光杂交(FISH)、基因芯片和基因测序(NGS)。PCR是目前发展成熟、应用广泛、医生接受度较高的基因检测技术。后起之秀NGS试剂盒虽然价格相对传统检测手段较高,但一次可检测多个靶点。高灵敏度、高准确度和高利润率使得NGS受到科研人员、药物研发者与医疗检测服务提供者的青睐,普及率在近年迅速提升。企业代表:传统临检机构(金域医学,迪安诊断),新兴二代测序基因检测公司(燃石医学,世和基因),IVD研发生产与运营公司(艾德生物)
过去几年里,陆续有企业开发出了寻找几个特定基因片段的肿瘤基因检测产品。目前,在研发阶段,中国对于伴随诊断缺乏清晰的定义,尚无负责伴随诊断的专门机构,也没有国内检测公司与药企一同进行全流程的伴随诊断,共同研发并一同上市;在临床使用阶段,中国政府规定了部分用药检测必须使用NMPA批准的试剂盒。自2018年下半年以来,国家药监局NMPA相继批准6款这样的肿瘤NGS检测产品:(燃石肺癌4基因 ➝ 诺禾肺癌6基因 ➝ 世和肺癌6基因 ➝ 艾德肺癌/结直肠癌10基因 ➝ 艾德卵巢癌BRCA1/2 ➝ 华大肺癌3基因 ➝ ?)。
但是,只针对几个基因组合肿瘤检测试剂盒有其局限性。人体和疾病的情况很复杂,肿瘤的成因不仅仅是少数几种,可实施的化疗、免疫等治疗方案也层出不穷。因此需要开发出覆盖更多基因位点的检测产品,实现更精准的识别。
在基因检测领域,Panel指的是包含不同数量基因的组合。少数几个基因的组合通常被称为小Panel,相对应的一般包含上百个基因组合的称为大Panel。我们可以发现,多基因的肿瘤NGS小panel检测试剂盒已经相继获批,大panel的申报将是一种趋势。
之所以要检测更多的基因,实在是因为癌症太变化多端。以中国发病率最高的肺癌为例。一般人只知道长在肺上的恶性肿瘤叫肺癌,而现代医学依据肺癌发病原因的不同,将肺癌分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌,非小细胞肺癌又包括了鳞癌、腺癌、大细胞癌等。目前癌症进入了分子分型的时代,根据基因变异不同,又可以将癌症分为不同的类型。癌症,早就不再是一个疾病,而是一系列疾病的组合。
21世纪以来开发的各类靶向癌症治疗药物,实际上就是针对这些不同分子分型的癌症专门研究的“武器”。要做到对症下药,首先要知道“症”是哪种分子分型,否则靶向治疗就没有效果。患者白花钱不说,还延误了宝贵的治疗窗口期。
癌症的分子分型需要进行基因检测。
小Panel检测能很准确的分辨出几类常见的肿瘤用药靶点基因变异,成本也较低。大多数场景下,已能满足临床诊断需要,为医生准确指导用药。
但肿瘤发生发生发展机制复杂,随着对肿瘤基因组研究的不断深入,发现的与肿瘤治疗相关的基因、标志物也越来越多。实现肿瘤精准分子分型需要检测的基因、变异类型越来越多,这时候,大Panel的临床重要性就凸显出来了。
以往检测大Panel的意义并不大,因为即便了解了,也无药可治。如今,越来越多的肿瘤治疗药物和方法层出不穷,医生手里的“武器”多了,却又产生了“选择焦虑”。
当然,几个小Panel检测的叠加,也能帮助医生找到合适的“武器”。只是患者能否接受多次组织取样,还有就是等不等得起,这都是医生要考虑的问题。
能一劳永逸实现对不同肿瘤的多方位检测,这是美国FDA给基因检测企业提出的要求。开发大Panel的想法由来已久,纵观美国FDA批准的肿瘤NGS检测产品(Foudation Focus CDx BRCA ➝ Oncomine Dx Target Test ➝ Praxis Extended RAS Panel ➝ MSK-IMPACT 468基因 ➝ FoundationOne CDx 324基因),我们可以发现肿瘤NGS检测的未来发展趋势一定是从单一癌种到多癌种,单基因到多基因,小panel到大panel。国内尚未有大Panel品种获批。
大Panel只有覆盖检测基因足够广的时候才能为患者和医生提供“武器”,“武器”好不好用还体现在检测的灵敏度和特异性上。目前在基因检测时要进行核酸扩增,每一步都有可能产生误差。从核酸的提取、测序文库的构建、基因序列读取,这些过程中都会带来检测误差。检测时需要排除掉误差带来的突变,真正能检测出每个患者不同的突变,同时兼顾检测覆盖的基因范围和检测准确度。几百个基因,每个都要精准的识别出来,这需要很强技术能力和质控能力。
可以说,大Panel是治疗药物、检测技术以及医患理念三者共同进步到一定高度后,才会应运而生的。
肿瘤突变检测NGS产品研制现状:
- 不同应用方向的肿瘤基因突变检测:癌症早筛,病毒感染,甲基化,单细胞检测等。
- FDA批准靶向治疗用药伴随诊断试剂盒:一个基因,一个药物,一个伴随诊断试剂盒 → 一个癌种,一个伴随诊断试剂盒,多个药物,多个基因 → 泛癌种检测试剂盒或平台(F1CDx,MSK-IMPACT)。
- NGS肿瘤基因检测大panel:可检测突变类型有哪些?(SNV?indel?CNV?fusion?TMB?MSI?)检测基因数目?(?基因)检测panel大小?(?Mbp)等。
- 肿瘤复发监测产品:宏观 → 微观(细胞、分子),单一(单组学)→ 系统(多组学)。
- 肿瘤早期筛查产品:FDA批准的Cologaurd产品(CRC早筛,KRAS突变+NDRG4及BMP3甲基化+便潜血),Grail的CCGA研究(用大人群数据验证GRAIL多组学早筛产品性能,为资质申报积累数据)等。
商业模式:
- IVD模式:传统进院模式,检测公司通过招标采购向医院提供试剂盒,在院内使用。该模式是目前最稳定的商业模式,合规性高。直接生产获批试剂盒并针对重点医院销售的模式节省了中间成本,IVD注册门槛较高也使得市场竞争较少,代表公司如艾德生物。
- ICL模式:目前较为主流的模式,医院将检测服务外包给第三方检测公司进行。该模式需要大规模的销售团队覆盖各个医院的医生,销售成本较高;市场上以该模式运营的检测公司数量庞大,竞争激烈;国家对其监管与规定较少,检测结果质量难以保证,机构面临较大的合规性风险;代表公司如泛生子。
- 共建实验室模式:医院和检测公司合作,由检测公司搭建检测系统,包括设备采购、技术导入、人员培训等,以建立与医院的长期合作。作为一种稳定合作模式,其面临较小的竞争(共建模式的高投资与高壁垒)与合规性风险,但该模式所需的初始投入很大;代表性公司为燃石医学。
Ref:面对超1000亿的大市场,肿瘤检测“大Panel 654”面世
CSCO卫星会笔记丨NGS肿瘤检测大panel的标准建设与评价
百舸争流!中国肿瘤基因检测市场的现状与未来
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