一、安装与加载

install.packages("corrplot", lib=<此处可以指定安装路径，在服务器生产环境中特别有用>)
library(corrplot)

二、数据前处理

加载示例数据集

> data(mtcars)
> head(mtcars)
                   mpg cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4         21.0   6  160 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag     21.0   6  160 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710        22.8   4  108  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Hornet 4 Drive    21.4   6  258 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Hornet Sportabout 18.7   8  360 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Valiant           18.1   6  225 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1   1
## Hornet Sportabout 18.7   8  360 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
## Valiant           18.1   6  225 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1

计算相关系数

> M <- cor(mtcars)
> head(M, 2)
          mpg       cyl       disp         hp       drat         wt
mpg  1.000000 -0.852162 -0.8475514 -0.7761684  0.6811719 -0.8676594
cyl -0.852162  1.000000  0.9020329  0.8324475 -0.6999381  0.7824958
          qsec         vs         am       gear       carb
mpg  0.4186840  0.6640389  0.5998324  0.4802848 -0.5509251
cyl -0.5912421 -0.8108118 -0.5226070 -0.4926866  0.5269883

二、设置不同系列颜色

col1 <- colorRampPalette(c("#7F0000", "red", "#FF7F00", "yellow", "white",
                           "cyan", "#007FFF", "blue","#00007F"))
col2 <- colorRampPalette(c("#67001F", "#B2182B", "#D6604D", "#F4A582",
                           "#FDDBC7", "#FFFFFF", "#D1E5F0", "#92C5DE",
                           "#4393C3", "#2166AC", "#053061"))
col3 <- colorRampPalette(c("red", "white", "blue"))
col4 <- colorRampPalette(c("#7F0000", "red", "#FF7F00", "yellow", "#7FFF7F",
                           "cyan", "#007FFF", "blue", "#00007F"))
wb <- c("white", "black")

当然也可以用其他调色包

三、基本绘图语法

# methold参数设定不同展示方式
corrplot(M) #默认methold="circle"

image

四、样式调整

上三角

# type参数设定展示类型，默认type="full"展示全部
corrplot(M, order='AOE', type = "upper")

image

常用参数：

corr：需要可视化的相关系数矩阵 method：指定可视化的方法，可以是圆形、方形、椭圆形、数值、阴影、颜色或饼图形

type：指定展示的方式，可以是完全的、下三角或上三角

col：指定图形展示的颜色，默认以均匀的颜色展示

bg：指定图的背景色 title：为图形添加标题

is.corr：是否为相关系数绘图，默认为TRUE，同样也可以实现非相关系数的可视化，只需使该参数设为FALSE即可

diag：是否展示对角线上的结果，默认为TRUE

outline：是否绘制圆形、方形或椭圆形的轮廓，默认为FALSE

mar：具体设置图形的四边间距

addgrid.col：当选择的方法为颜色或阴影时，默认的网格线颜色为白色，否则为灰色

addCoef.col：为相关系数添加颜色，默认不添加相关系数，只有方法为number时，该参数才起作用

addCoefasPercent：为节省绘图空间，是否将相关系数转换为百分比格式，默认为FALSE

order：指定相关系数排序的方法，可以是原始顺序(original)、特征向量角序(AOE)、第一主成分顺序(FPC)、层次聚类顺序(hclust)和字母顺序，一般”AOE”排序结果都比”FPC”要好

hclust.method：当order为hclust时，该参数可以是层次聚类中ward法、最大距离法等7种之一

addrect：当order为hclust时，可以为添加相关系数图添加矩形框，默认不添加框，如果想添加框时，只需为该参数指定一个整数即可

rect.col：指定矩形框的颜色

rect.lwd：指定矩形框的线宽

tl.pos：指定文本标签(变量名称)的位置，当type=full时，默认标签位置在左边和顶部(lt)，当type=lower时，默认标签在左边和对角线(ld)，当type=upper时，默认标签在顶部和对角线，d表示对角线，n表示不添加文本标签

tl.cex：指定文本标签的大小

tl.col：指定文本标签的颜色

cl.pos：图例（颜色）位置，当type=upper或full时，图例在右表(r)，当type=lower时，图例在底部，不需要图例时，只需指定该参数为n

addshade：只有当method=shade时，该参数才有用，参数值可以是negtive/positive和all，分表表示对负相关系数、正相关系数和所有相关系数添加阴影。注意：正相关系数的阴影是45度，负相关系数的阴影是135度

shade.lwd：指定阴影的线宽

shade.col：指定阴影线的颜色