RNA抽提

作者: 嘉期几许 | 来源:发表于2020-05-01 15:37 被阅读0次

TRIzol法

  1. 细胞准备


    image.png

    不用pbs洗

  2. 转移入ep管中,上下摇混20次, 室温静置5min
  3. 加入1/5体积氯仿(ie,1mlTRIZOL加200ul氯仿),大力上下颠倒混匀20次,室温静置5min
  4. 4°,12000r/min,离心15min
  5. 小心吸取上层水相移入新的1.5mlep管中,加入等体积异丙醇,
    上下颠倒混匀25~ 30次,室温静置10~15min
    勿吸沉淀
    image.png
  6. 4°,12000r/min,离心10min
    离心后在管侧面和底部形成白色沉淀
  7. 弃上清,轻轻加入1ml 75%乙醇(用depc处理水配制而成),让RNA沉淀轻轻漂起来,或者保持原位
  8. 4°C, 7500 r/min , 离心 5min
  9. 弃上清,倒扣ep管,室温干燥5-10min
    别掉下来
    此时RNA沉淀微微湿润呈啫喱状
  10. 配置原液,白沉淀中加入20ulDEPC处理水
  11. 定量:
  • 将溶于DEPC处理水的RNA进行适量稀释。
    50倍或100倍稀释(98ul去离子水加2ulRNA或99ul去离子水加1ulRNA,总体积100ul)
  • 分光光度计定量,开机后选择RNA定量,先用100ul去离子水做空白读数去除背景,再检测样品,读取OD260值及OD260/OD280比值。
  1. q&a
  • 纯的RNA其OD260/OD280应为1.8~2.0,如果比值偏小,则有机溶剂或蛋白污染较 严重。如果比值偏大,则RNA可能已发生降解。
  • OD260在0.1~1.0之间,OD260/OD280的读数才可信
  • RNA浓度= OD260×40×稀释倍数/1000
  1. -80保存RNA样本

逆转录
TAKARA RR047A试剂盒 每个复孔 2ul

  1. 冰上配制MIXI:
  • 1.gDNA Eraser 1ul
    1. 5X gDNA Eraser Buffer 2ul
    1. RNase Free dH2O upto 10ul
      total RNA 根据浓度计算体积 2ug/浓度。 算出每个样本取的体积
      离心:shunli
  1. 上机:42°,2min,4°, ∞。 MAIN, 047A1, RUN, 20UL, OK, RUN
  2. 冰上配置 MIXII
  • 上一步骤的反应液 20ul
  • 3.PrimeScript RT Enzyme Mix I 2ul
    1. 5X PrimeScript Buffer 2 (for real time) 8ul
    1. RT Prime Mix 2ul
    1. RNase Free dH2O 8ul 总共40ul
      离心(损离),充分混匀,
  1. 上机 37° 15min,85° 5sec, 4° ∞ 。 RECENT, SYBR2, 40UL
    测定RNA 浓度决定体系体积:
    测RNA浓度机器:开机,选nucleotide,选择RNA.,清洗。 用水2ul,洗红点。擦掉。加2ul水,选择Blank,样本吸2ul,选择Sample,记下rna浓度。

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