只应该用直系同源基因构建物种系统发生树?
当从一组序列构建系统发生树时,主要的假设是他们来自同一个祖先序列,即它们是同源的。
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旁系同源paralogous的定义----最近共同祖先发生在一个基因重复事件之前的一堆基因。
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直系同源ortholog的定义----最近共同祖先发生在一个物种形成事件之前的一对基因。
一个基因的进化历史,有两次单独的重复事件
在这个进化时期结束后,两个物种里的所有的5个基因都是同源的,有3个直系同源对:Aβ/Bβ,Aα/Bα和Aα/Bγ。Bα和Bγ是旁系同源,任何其他的组合被认为是直系同源对。
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