path=`pwd`
find *gtf | sed 's/.gtf//g' | awk '{print "'$path'/"$0".gtf"}' > sample_lst.txt
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find *gtf | sed 's/.gtf//g' | awk '{print "'$path'/"$0".gtf"}' > sample_lst.txt
问题：stringtie组装转录本后会改变原本参考基因组注释文件中的gene_id stringtie 组装、me...
StringTie: 一款RNA-seq序列转录本重构软件 转录本测序方法通常会产生大于200 milli...
转自转录组差异表达分析工具Ballgown | Biochen生物 Ballgown的输入文件 StringTie...
hisat2+stringtie 转录组
转录组分析使用stringtie定量后，如果使用DESeq2进行下游分析，需要使用prepDE.py生成read ...
第一行SRR后面有一个逗号 最开始没写这个逗号，一直遇到报错 Building DAG of jobs... Mi...
Python txt文件合并，可适用合并所有文本类文件 把python脚本放在同文件夹下生成合成.log合并文件 ...
一：合并文件 目的是：合并两个文件解决方法：用merge合并两个文件，通过相同的列名Gene_Symbol 生成的...
呃，最近在做转录本的组装，然后需要用到stringtie，在看报错信息的时候，看得一脸懵逼。这是啥啊，都是乱码。我...
慢慢练。记录笔记。这个得到结果很慢，写的不简练从stringtie生成的gtf文件中提取fpkm值。并且将相同基因...
本文标题：2022-08-15 生成stringtie合并转录本所需文件
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/wgbkgrtx.html
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