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计算相关系数

计算相关系数

作者: 余绕 | 来源:发表于2020-05-18 00:07 被阅读0次
#计算相关系数

setwd('C:/Users/Tao/Desktop')
expr=read.delim('TPM1.txt',header=T,row.names = 1,sep = "\t",na.strings = '-') #读取表达矩阵
r=cor(expr,method='pearson',use='pairwise')  
# method可选 pearson 或者spearman
# use="pairwise" 表示剔除缺失

write.table(r,file='pearson.r.txt',col.names = NA,quote=F,sep="\t")

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