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UMAP 将会与tsne一样作为高纬数据可视化的利器，并且优于tsne. UMAP 与 t-SNE 均是非线性降维...
目前单细胞数据做降维分析的方法有很多（PCA,TSNE,UMAP），大家不用一个一个的去试，掌握一些主要的分析软件...
umap发现自己的簇顺序有问题 设置一下因子就好 ggplot绘制umap图 你到底想要什么样的umap/tsne...
注：仅作个人科研生涯学习思考之用，侵删。 单细胞笔记5-tSNE和UMAP[https://www.jianshu...
如何结合PCA和tSNE进行降维？如果表达矩阵过大(几千个细胞x几万个基因)，用tSNE降维将会非常慢。这是可以先...
在上一篇中，我已经讲解了展示marker基因的前两种图形，分别是tsne/umap图、热图，感兴趣的读者可以回顾一...
这一篇是我的学习笔记，先附上学习链接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERH...
为何要降维？方便可视化探索；减轻维度诅咒；缓解共线性。降维方法：PCA, t-SNE, UMAP, SOM, LL...
Seurat包展示出来的umap/tsne图都是带有横纵坐标，基于Seurat包可能比较难调整图片的样式，只能借助...
随着单细胞通量的提高，对我们的计算速度要求也越来越高。我们知道在绘制图谱的时候现在有两个选择:tsne和umap。...
本文标题：scRNAseq在tsne/umap前要进行pca
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/wiymedtx.html
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