对于LC/ESI-MS等软电离方法,除了质子化的分子离子外,还会产生不同种类的离子。这些是加合物(例如[M+K]+,[M+Na]+)和片段(例如[M]−C3H9N]+,[M+H−H20]+)。根据具有固有电荷的分子,也可以观察到[M]+。在大多数情况下,一种物质会产生大量不同的离子。这种解释非常耗时,尤其是当物质共洗脱时。因此,分离不同物质并发现离子种类的反褶积是必要的。
安装
BiocManager::install("CAMERA")#
library(CAMERA)
dda_data <- xcmsSet("../Centroid/neg_20211-fa-51.mzML",method="centWave", ppm=30, peakwidth=c(5,10))
xsa <- annotate(dda_data)
#可视化结果
plotPsSpectrum(xsa,maxlabel=20, pspec=1:10)#maxlabel展示离子的标签数量,pspec展示峰的数量。
plotPsSpectrum(xsa,pspec=6)
plotPsSpectrum(xsa,maxlabel=12, pspec=1:8)
网友评论