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删除变量
数据结构

'identical(x,y)#看一下x和y是否一致，包括数据类型、长度是否一致'
'#如果一致，则输出为TRUE，不一致则输出为FALSE'

数据结构也讲完啦

今天晚上讲R package

Rmarkdown(.Rmd)

Rmarkdown

1. 函数与参数

• 1.1 形式参数与实际参数

形式参数和实际参数

• 1.2 写函数的函数

函数名
image.png

大括号里面是编写函数用的代码

image.png

• 1.3 默认参数

默认参数

2. R package介绍

WHAT
WHY
CHICKEN SOUP

• 2.1 R包来源及安装

install.packages(“stringr”)#CRAN来源R包安装代码
BiocManager::install(“stringr”)#Bioconductor来源R包安装代码
devtools::install_github(“A/B”)#github来源R包安装代码，A为用户名，B为包名

Bioconductor网站 本地安装github

图片中绿色的地方是下载，下载后放在工作目录，随后进行本地安装

• 2.2 R包加载

R包加载
library(ggplot)#加载ggplot包
reguire(ggplot)#加载ggplot包

对于一些问题的解决办法

试一试，搜一搜

• 2.3 R包安装前需设置镜像

R包镜像
设置R包镜像方法1

"设置R包镜像方法2"

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

• 2.4 R包安装和使用的逻辑

• （1）安装包-加载包-使用包里的函数

如报错：找不到函数，则加载函数所在的包，重试。
如报错：不存在叫xx名字的包，则安装xx包，重试。

library()#是检查是否安装成功的标准

image.png

• （2）已安装、不加载，直接使用

BiocManager::install()
dplyr::filter()
包名 ：：函数名，表示显式的指定用某个包里的某个函数，通常用于实战中仅用一次的函数，也适用于两个包中的函数名有冲突的情况。

image.png

• 2.5 常见疑问

(1)大片提示信息

image.png

(2)packages not available

packages not available
image.png

(3)是否更新？

update all/some/none?[a/s/n]:

update .png
update ge.png CHICKEN SOUP

(4)加载A包，报错B包不存在

image.png
image.png
image.png image.png

(5)报错中有connection或url

切换镜像，检查网络连接。如果都没有问题，运行
options(download.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')
再重新下载。

(6)判断式的安装

if(!require(stringr))install.packages("stringr")
## Loading required package: stringr

1

• R语言里的符号

image.png
CHICKEN SOUP CHICKEN SOUP

不要那么干，显得很不专业——花花

一定不要太勤快，不然你学不好编程——花花

莫挨老子，不想理你——花花