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我们平时最常用的富集分析方法就是Over-Represence Analysis(ORA)，本质上是一次不放回抽样的概率事件。在这里首推CJ大神写的推文：GO富集分析 从原理到实践 ~ 零基础掌握。大家可以自行阅读，熟悉一下富集分析的原理。
当你了解了富集分析背后的原理后，你就能明白：所谓转录因子富集分析，就是以全基因组各个家族的转录因子为背景，通过比较给定的基因中各个家族的转录因子的数量及比例来计算其显著性。为了达到这一目的，我们需要做的无非是三件事：
转录因子富集分析 转录因子因子富集分析背后的原理与GO，KEGG等富集分析是一样的。 这里还是使用Y叔的R包“cl...
1。首先去下面的这个网站http://software.broadinstitute.org/gsea/msigd...
看到了jimmy老师的下述文章，才发现之前写的RNAseq实战还漏了个转录因子富集分析：常规转录差异建议都加上一个...
Cistrome-GO是对chip-seq数据得到的转录因子调控的基因进行富集分析的网站。它同时可以结合表达谱数据...
转录因子分析的流程 一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Trans...
基因集的转录因子富集[https://mp.weixin.qq.com/s/mBR3IwWvQDcTOXNwM_Y...
一般来说，大家拿到了感兴趣的基因集后，通常是做超几何分布检验看看富集到了什么生物学功能数据库，比如KEGG或者GO...
转录因子分析可以了解细胞异质性背后的基因调控网络的异质性。转录因子分析也是单细胞转录组常见的分析内容，R语言分析一...
现在已经找出了转录因子的结合位点，那么这些位点所调控的基因具有什么功能，就得需要进行功能富集分析。有两种方法 方法...
转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装...
本文标题：转录因子的富集分析
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