1）InnoDB支持事务，MyISAM不支持，这一点是非常之重要。事务是一种高级的处理方式，如在一些列增删改中只要哪个出错还可以回滚还原，而MyISAM就不可以了。
2）MyISAM适合查询以及插入为主的应用，InnoDB适合频繁修改以及涉及到安全性较高的应用
3）InnoDB支持外键，MyISAM不支持
4）从MySQL5.5.5以后，InnoDB是默认引擎
5）InnoDB不支持FULLTEXT类型的索引
6）InnoDB中不保存表的行数，如select count() from table时，InnoDB需要扫描一遍整个表来计算有多少行，但是MyISAM只要简单的读出保存好的行数即可。注意的是，当count()语句包含where条件时MyISAM也需要扫描整个表
7）对于自增长的字段，InnoDB中必须包含只有该字段的索引，但是在MyISAM表中可以和其他字段一起建立联合索引
8）清空整个表时，InnoDB是一行一行的删除，效率非常慢。MyISAM则会重建表
9）InnoDB支持行锁（某些情况下还是锁整表，如 update table set a=1 where user like ‘％lee％’。 收起
10）MySQL 5.6 之前版本，InnoDB 不支持全文索引，只能通过插件变相支持。但是在 5.6 及以后的版本，MyISAM 和 InnoDB存储引擎均支持全文索引。
如何选择：1. 是否要支持事务，如果要请选择 InnoDB，如果不需要可以考虑 MyISAM；2. 如果表中绝大多数都只是读查询，可以考虑 MyISAM，如果既有读写也挺频繁，请使用InnoDB。3. 系统奔溃后，MyISAM恢复起来更困难，能否接受，不能接受就选 InnoDB； 4. MySQL5.5版本开始Innodb已经成为Mysql的默认引擎(之前是MyISAM)，说明其优势是有目共睹的。如果你不知道用什么存储引擎，那就用InnoDB，至少不会差。
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