R包之seurat

作者: 一小鲸儿 | 来源:发表于2020-10-31 17:58 被阅读0次

R包之seurat
2021-06-07 R查看版本
R包hdf5r安装报错-load filed
seurat
关于R包降级
细胞鉴定方法
Seurat使用教程（v3.0）
Seurat学习与使用（一）
单细胞转录组3大R包系列学习笔记
Seurat V3联合harmony进行单细胞数据整合分析

#加载并查看Seurat中的数据
devtools::install_github('satijalab/seurat-data')
library(SeuratData)
AvailableData()
#需要加载某个数据时
InstallData("pbmc3k")
 data("pbmc3k")
#参看作者信息
citation('cbmc.SeuratData')

R储存生信图片格式
Orientation：landscape(横屏)

R包之seurat
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2021-06-07 R查看版本
查看R安装包的版本packageVersion("Seurat") 加载包并查看library(Seurat)se...
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Seurat[https://satijalab.org/seurat]是一个r包，被设计用于单细胞rna-seq...
关于R包降级
很多情况下，我们会想切换R包版本，降级的方法就是：以Seurat包为例：
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基于R包对细胞类型鉴定,使用singleR包对细胞类型预测，singleR能够与seurat包完美结合，使用比较方...
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Seurat使用教程（v3.0） Seurat是一个分析单细胞转录组数据的R包，用于QC，分析和探索单细胞RNA-...
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简介 Seurat是一个r包，被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识...
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Seurat包学习笔记 Seurat包学习笔记（一）：Guided Clustering TutorialSeur...
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#R包导入 #数据数据下载pbmc_stim 数据导入 #初始化Seurat 对象使用Harmony之前，需要...