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学习小组Day3笔记--Mengshangsen

学习小组Day3笔记--Mengshangsen

作者: 谁家东风花正好_何处西山日渐薄 | 来源:发表于2020-10-18 23:24 被阅读0次

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Bioconda


代码整理
wget 下载链接 
bash .sh脚本 
source ~/.bashrc 
conda config --add channels [https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/freeconda]
(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/freeconda) config --add channels [https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forgeconda]
(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forgeconda) config --add channels [https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/biocondaconda]
(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/biocondaconda) config --set show_channel_urls yes

conda list
conda search fastqc
conda install fastqc -y
conda remove fastqc -y

conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
conda active rna-seq
conda deactivate

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