研究人员建立了一个深度学习模型，DeepSTARR，直接从黑腹果蝇S2细胞的DNA序列中定量预测了数千个发育和管家型增强子的活性。该模型学习了相关的转录因子（TF）模体和高阶语法规则。研究人员在实验中验证了这些规则，并通过测试4万多个野生型和突变型果蝇和人类增强子，证明它们可以推广到人类。最后，研究人员设计并在功能上验证了具有理想活性的合成增强子。
研究人员建立了一个深度学习模型，DeepSTARR，直接从黑腹果蝇S2细胞的DNA序列中定量预测了数千个发育和管家型增强子的活性。该模型学习了相关的转录因子（TF）模体和高阶语法规则。研究人员在实验中验证了这些规则，并通过测试4万多个野生型和突变型果蝇和人类增强子，证明它们可以推广到人类。最后，研究人员设计并在功能上验证了具有理想活性的合成增强子。
DeepSTARR predicts enhancer activity from DNA sequence an...
顺式作用原件： DNA序列，位于基因序列的上游或下游，不编码蛋白，仅提供作用位点 「启动子，增强子，调控序列」 反...
DNA聚合酶活性 RNase H活性 热稳定性 持续合成能力 保真度 末端核苷酸转移酶（TdT）活性 逆转录酶是从...
启动子、增强子、沉默子、顺式作用元件等都是DNA序列上的结构概念，mRNA里面是不包含的！ 5'UTR和3'UTR...
转录因子（TFs）可以通过结合其启动子或增强子的特定DNA序列来调节靶基因的表达。鉴定人中的TF-靶标调控是了解生...
前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件，可以筛选DNA序列中的散在重复序列和低复杂序...
使用shell求DNA序列的反向序列： 使用Shell 求 DNA 的互补序列： 使用 Shell 求DNA反向互...
DNA通过转录，控制着mRNA的合成，而mRNA是蛋白质合成的模板，它决定了蛋白质的序列结构、功能等信息。把mRN...
欢迎关注”生信修炼手册”! 增强子是真核生物基因组中的一段长度在几十到几千bp之间的DNA序列，可以显著提高靶标基...
基础知识--增强子 一、定义 增强子(Enhancer) 又可译为强化子，是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与...
本文标题：DeepSTARR可从DNA序列预测增强子的活性并能从头设计合成
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/xspgfdtx.html
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