美文网首页甲基化
复盘总结(五)

复盘总结(五)

作者: 蓬举举 | 来源:发表于2021-01-04 21:35 被阅读0次

    今天做展示PPT的时候发现可以用一种更简单的方式计算之前计算过的内容,因此更新一下之前的结果。
    1.相关性分析结果

    > cor.test(merge_1$value, merge_1$rate,method = c("pearson"))
    
        Pearson's product-moment correlation
    
    data:  merge_1$value and merge_1$rate
    t = -6.7244, df = 198313, p-value = 1.769e-11
    alternative hypothesis: true correlation is not equal to 0
    95 percent confidence interval:
     -0.01949810 -0.01069772
    sample estimates:
           cor 
    -0.0150982 
    

    2.组织特异性甲基化的启动子区域

    > nrow(methpromspec)
    [1] 2006
    > nrow(exprsetspec)
    [1] 12059
    > nrow(merge_2)
    [1] 24
    

    得到2006个组织特异性甲基化的启动子区域。(由17702个启动子区域得到)
    overlap数目为24个。

    相关文章

      网友评论

        本文标题:复盘总结(五)

        本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/xtxboktx.html