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表达质粒构建

表达质粒构建

作者: 找兔子的小萝卜 | 来源:发表于2020-09-22 15:54 被阅读0次

    1 反应体系:

    2*Phanta max master mix:25ul
    R:2ul(10uM)
    F:2ul(10uM)
    cDNA:21ul(稀释过的)

    2 反应条件:

    95℃ 3min
    95℃ 15s
    60℃ 15s
    72℃ 1000bp/min
    (2-4步30个循坏,不能多。)
    72℃ 10min
    4℃ (持续)

    3 琼脂糖1%+1%EB

    样品中加10x lodding buffer
    样品在负极,120V 40min 电泳
    紫外灯,切胶 回收DNA。

    4胶回收后

    按照‘gel kit’试剂盒提取纯化DNA,40ul dd水 60℃预热溶解DNA。

    5 酶切

    DNA(提取纯化的):40ul;
    5 μL 10x cut smart buffer
    1 μL Cla1
    1 μL kpn1
    ddH2O补至50 μL

    5 μg pLKO.1
    5 μL 10x cut smart buffer
    1 μL Cla1
    1 μL Kpn1
    ddH2O补至50 μL
    37度酶切过夜

    6 通过琼脂糖电泳获得线性化质粒,同时进行纯化回收。

    DNA需要使用纯化试剂盒直接纯化,质粒需要电泳跑胶纯化(胶中的质粒必须在曝光仪器上观看,紫外容易导致突变)
    质粒酶切的时候会出现单链断裂等情况,所以我们需要跑胶,进行胶回收,纯化。质粒需要用50ul水溶解,DNA片段需要使用20ul的水溶解。

    7连接

    将退火产物与线性化质粒进行T4连接酶连接,连接过夜。

    15ul 目标DNA片段(如果使用20ul,则14ul就可以)

    2ul 线性化质粒(如果使用50ul,3ul质粒)

    2μL 10x NEB T4 DNA ligase buffer

    1μL NEB T4 DNA连接酶

    (16度 连接过夜)

    8转化

    [ 基本原理 ]

    将质粒 DNA 导入细菌的过程称为转化( Transformation )。此感受态细菌细胞在 CaCl 2 低渗溶液中膨胀为球状(感受态细菌的制备,见前)。质粒 DNA 与 CaCl 2 形成抗 DNase 羟基 - 磷酸钙复合物黏附于细菌表面,经 42℃ 短时间热冲击处理,促进细胞吸收 DNA 复合物。在丰富培养基上生长数小时后,球状细胞复原并分裂增殖。被转化的细菌中,外源基因得到表达。在选择性培养平板上,可选出所需的转化子(即含有质粒 DNA 的细菌)。钙处理的感受态细胞,一般每微克 DNA 能获得 10 5 ~ 10 6 个转化子。除化学方法转化细菌外,还有电穿孔法( Electroporation ),其转化率可高达 10 9 ~ 10 10 个转化子 /μg 质粒 DNA 。

    [ 器材 ]

    1 .培养皿 2 .恒温培养箱

    [ 试剂 ]

    1 . LB 培养基

    2 .选择性 LB 琼脂培养平板(含氨苄青霉素,终浓度为 50μg/ml )

    3 .氨苄青霉素 100 mg/ml

    4 .宿主细菌:经 100 mmol/L CaCl 2 处理的感受态细菌 DH5α

    [ 操作步骤 ]

    • 取 50 μL 大肠杆菌感受态细胞,加入适量质粒(全部的连接产物 )冰浴 30 min 后, 42℃ 热激 70 s ,马上放回冰上,冰浴 5 min ;加 1ml LB 培养基(无Amp),于 37℃ 摇床慢摇振荡培养 60 min ;3000rpm 4min离心,倒掉上清,下面的沉淀物混匀涂板。取 50-100 μL 涂在含有氨苄青霉素( 100 μg/mL )的 LB 固体培养基上, 37℃ 倒置培养过夜。(如果涂上去的液体过多,则正置1h后倒置。

    9 挑克隆

    每个样品挑5个克隆 、ep管中加10uldd水 挑入克隆捶打混匀。取出八连管:
    mix :10ul
    Flag-R:1ul ;
    GFP-F:1ul ;
    克隆混合液:3ul ;

    程序
    pcr:95 3min
    95 15s
    56 15s
    72 90s
    72 10min
    4 持续
    2-4 30个循环
    完成后看切的条带大小,一般跑胶,在皮曝光机器下看,与自己目的蛋白一样大小的kb带出现则提示连接成功。注意marker的选择。

    然后将剩余7ul的克隆混合液加入amp的lb培养基800ul的样子 在摇床中摇 。

    跑完胶后发现正确的条带后,将摇床上正确条带的菌群,转移到15ml的摇菌管,摇菌过夜。

    10 抽取质粒DNA,送去测序,获得正确组装质粒。

    测序引物

    先测反向:

    pFlag-CMV-R: GCACTGGAGTGGCAACTT(自己合成)
    再测正向:
    CMV-Forward
    21mer 5'-CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG-3(公司有免费通用)

    注:扩增的序列为mRNA的CDS区

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