R语言调色板

作者: ChrisJO | 来源:发表于2022-01-24 11:36 被阅读0次

    相信各位在肝图表写论文时,一定都会思考:这张图表用啥颜色?论文整体配色搭配怎么把控才好看?

    毕竟高分期刊大牛文章的共通点,除了论文精彩,整体配色也十分具有吸引力。

    许多在线配色/提取颜色的工具效果不错,通过下载大牛文章使用PS、AI等直接“偷色”也不是难事。如今即便自己缺少美学灵感,但仍可以做到轻松获取出彩的配色方案。有兴趣可参考往期推文: 《作图颜色调得好,高分文章跑不了!》 、 《如何“偷走”大牛文章漂亮的配色?》

    但上述方法可能不适用所有情景(特别是R绘图时)。只需要少量颜色的情况还好,直接通过十六进制颜色码自定义配色即可,做到好看十分简单。

    但当绘制一些如堆叠图、桑基图等的多分组图表时,当你需要自定义十几种甚至更多颜色时(如下图),在找配色上就会花费非常多的时间,根据数据的不同,有些需要渐变配色(容易一点),有些则需要离散配色(这个最难),不太适合懒人。

    ( ISME ,2021)

    因此,今天给大家介绍四个能轻松获取高分科学期刊同款配色方案的R包,并讲述如何基于这四个配色包,生成任意所需数量的超好看配色。当然,也能提取出配色方案,“反向”运用于Origin、AI、Excel等其它软件图形的绘制。

    # 1. ggsci #

    此包是基于ggplot2的颜色主题包,内置的配色方案都为各类科学期刊、科幻电影常用配色。由于篇幅受限,这里仅展示部分常用科学期刊配色,剩余大家自行查看帮助文档。

    #相关包的安装和载入

    install.packages('ggsci')

    library(ggsci)

    library(ggplot2)

    #查看此包帮助文档(共提供18种配色方案,点击名称即可跳转到对应配色说明及案例)

    vignette( "ggsci")

    #提取配色的通用函数(palname替换为配色方案名称即可,详见帮助文档)

    #scale_color_palname

    #scale_fill_palname

    #使用R内置数据集创建箱线图作为本次范例:

    data(singer,package= "lattice")

    p<-ggplot(singer,aes(x=voice.part,y=height,fill=voice.part,color=voice.part,alpha=0.8))+geom_boxplot

    p<-p+theme_bw+coord_fixed(ratio=0.25)

    #使用Nature配色(NPG)

    p2<-p+scale_color_npg+scale_fill_npg

    p2

    #使用Science配色(AAAS)

    p3<-p+scale_color_aaas+scale_fill_aaas

    p3

    #使用柳叶刀配色(Lancet)

    p5<-p+scale_color_lancet+scale_fill_lancet

    p5

    #使用Journal of Clinical Oncology配色(JCO)

    p6<-p+scale_color_jco+scale_fill_jco

    p6

    那么如何将心仪的颜色提取出来呢?不同的配色方案本质就是不同十六进制颜色码向量的集合。但ggsci包有些特殊,颜色向量集的名称并不和帮助文档中所给的对应配色方案名称对应,因此需要多一步自行查找。

    #查看选中配色方案的帮助文档 (以Nature的配色NPG为例)

    library( "scales")

    ? scale_color_npg

    查看NPG的帮助文档可发现,此配色方案包含共10种颜色,颜色向量集名称为“nrc”,可以调整透明度。

    #可选择提取≤10种颜色,但可通过调节透明度产出不同明度的配色方案

    mycolor<-pal_npg( "nrc", alpha = 0.5)(8) #提取8种颜色,透明度80%

    mycolor

    show_col(mycolor)

    ggsci包中其余配色方案也可通过此方法来获取十六进制颜色码,大家可根据需要直接复制颜色码或者保存配色图片。

    # 2. RColorBrewer #

    这个包的使用频率也非常高,上一周推文 《如何绘制Science文章的“花式”河流图?》 中就使用它进行配色。

    #RColorBrewer包的安装和载入

    install.packages('RColorBrewer')

    library(RColorBrewer)

    #查看帮助文档

    ? RColorBrewer

    #查看全部配色方案

    display.brewer. all

    #作者将上述配色方案分为了三类(从上至下):连续型(sequential)、离散型(Qualitative)、极端型(Diverging),可适用于不同类型的分类变量(非常方便!),以下代码可分别进行查看

    display.brewer. all(type= "seq")

    display.brewer. all(type= "qual")

    display.brewer. all(type= "div")

    #使用Spectral配色方案

    mycolor2<-brewer.pal(11, "Spectral")#可选择的颜色数量区间在此配色最大数和绘图所需数之间

    p7<-p+scale_fill_manual(values=rev(mycolor2))+

    scale_color_manual(values=rev(mycolor2))

    p7

    #使用YlOrRd配色方案

    mycolor3<-brewer.pal(9, "YlOrRd")

    p8<-p+scale_fill_manual(values=rev(mycolor3))+

    scale_color_manual(values=rev(mycolor3))

    p8

    RColorBrewer包可直接提取配色,颜色集合的名称和配色方案名称相同。

    #提取所需配色的十六进制颜色

    brewer.pal(9, "YlOrRd")

    show_col(mycolor3)

    两个包的基础用法就介绍到这。此外,文首提到的常见情况——分类变量非常多的情况怎么办?上述R包里每种方案所包含的颜色数量似乎也就10来种,似乎不够用?

    #方法一:

    使用colorRampPalette扩展上述R包颜色

    #这个函数的基本用法:基于指定的颜色向量,生成指定数量的渐变颜色

    col3<-colorRampPalette(c('blue','white','red'))(30)

    show_col(col3)

    #使用colorRampPalette扩展R包配色方案中的颜色

    col4<-colorRampPalette(brewer.pal(8,'Set2'))(56)#将RColorBrewer包中的Set2方案8个颜色扩展为56个

    col5<-colorRampPalette((pal_npg( "nrc")(9)))(56)#将ggsci包中的NPG方案9个颜色扩展为56个

    show_col(col4)

    show_col(col5)

    当然,你也可以通过从配色包中提取出心仪的十六进制颜色码,去任意指定自己所需颜色,这里不再展示。

    #方法二:

    使用paletteer包

    朋友们,如果上述方法还不能满足你的要求,那就用用看paletteer!这个包中共收录了52个R包中的2,100种配色方案,都可直接调用,出现“配色荒”算我输!

    #paletteer包的安装、调用、查看帮助文档

    install.packages( "paletteer")

    library(paletteer)

    ? paletteer

    Paletteer包中针对不同数据类型(连续型、离散型),存在两种调用函数,详见下文:

    1.连续型配色方案:和colorRampPalette函数类似,可以基于选定的配色主题扩展出任意所需数量颜色。

    #生成连续型配色方案(基于选定的配色主题拓展出所需任意数量的颜色):

    c_palettes<- palettes_c_names#查看所有配色

    我们可以看到,连续型配色方案中共有330种方案,每个方案都可以生成指定数量颜色~

    #引号处配色名称可直接Tab键浏览选取,也可以直接输入,格式为:R包名称::配色方案名称

    paletteer_c( "gameofthrones::targaryen", n = 40)

    paletteer_c( "gameofthrones::arya", n = 15)

    paletteer_c( "pals::ocean.matter", n = 25)

    我们任意盲挑几种搭配,生成不同数量的颜色,如下图,十六进制颜色码都叠加在对应颜色上,我们在挑配色时就太方便啦(当然也可以生成色卡直接导出,见前文,这里不赘述)!

    2.离散型配色方案:虽然每种配色方案依然有最大颜色数限制,但架不住收纳的配色主题多啊(共有2,037种配色方案)!从几种,到十几种、二三十种、上百种颜色的配色方案都完美囊括。

    #生成离散型配色方案:

    d_palettes<- palettes_d_names#查看所有配色 ,共计2037种配色方案

    paletteer_d( "ggthemes::Classic_20",n=20) #随机选一个查看

    #将随机选取的Classic_20配色方案运用于箱线图示例:

    mycol<-paletteer_d( "ggthemes::Classic_20",n=20)

    p9<-p+scale_fill_manual(values=rev(mycol))+

    scale_color_manual(values=rev(mycol))

    p9

    真的随便乱挑出来的配色都好好看!

    #方法三:

    使用colorpicker包

    paletteer还不满足,看来是时候展现真正的技术,自己手动丰衣足食了!

    R语言的难点之一就是啥都要敲代码,搞得上个色都那么艰难。但是,colorpicker为我们提供了一个交互式颜色获取面板,让你能够体验“非R”的轻松愉快(简单来说,你可以不用敲代码直接点点点快速获取颜色)。

    #colorpicker包的安装、调用

    install.packages( "colourpicker")

    library(colourpicker)

    col_colourpicker<-#先设置需要赋值的颜色名,鼠标选择在Addins处选择colourpicker

    然后会出来一个交互式面板(像是在用别的软件了呢),如下:

    在Any colour面板,你可以点击“+”任意添加所需颜色数量,在“Select any colour”处任意挑选颜色,或者直接输入十六进制颜色码,如下图。

    在Find R colour面板,你可以任意选择一个颜色,并生成一组40个颜色以内的相近色搭配色板,根据需要点击颜色将其添加到“Selected colours”处。

    最后,在All R colour面板提供了好看的配色库可自行挑选添加,在完成颜色选择后,我们点击右上角的Done即可输出十六进制颜色码或者颜色名称。

    col_map<-c( "#E07979", "#801212", "#EDB4B4", "#4169E1", "#6CA6CD", "#48D1CC", "#FFC0CB", "#96CDCD")

    对于想自行控制配色的人来说,简直太方便啦!

    上述方法都能够快速生成任意所需数量的科学期刊配色方案!根据自己的需求选择适合自己的方法吧!今天的分享就到这里

    https://colorbrewer2.org/

    R语言生信绘图配色(GGSCI包)--SCI论文配色

    标签:生信R语言r语言视图设计rgb生物学

    R语言生信学习-GGSCI包介绍–SCI论文的配色

    对于我这条使用R语言来绘图的生信🐕而言,最令我绝望的便是关于配色的问题,很多时候自己选的颜色看上去会特别生硬,就算使用colorRampPalette产生渐变色也感觉不够理想。无意间,我看到了“ggsci”这个包,它完全就是为了SCI配色而设计的,下面我将挑选一些重要的函数来讲解,详细的内容可以去看官网的说明。

    内置函数介绍:

    这些是帮助页面中的函数以及简短的介绍:

    pal_aaas AAAS Journal Color Palettes

    pal_d3 D3.js Color Palettes

    pal_futurama The Futurama Color Palettes

    pal_gsea The GSEA GenePattern Color Palettes

    pal_igv Integrative Genomics Viewer (IGV) Color Palettes

    pal_jama Journal of the American Medical Association Color Palettes

    pal_jco Journal of Clinical Oncology Color Palettes

    pal_lancet Lancet Journal Color Palettes

    pal_locuszoom LocusZoom Color Palette

    pal_material Material Design Color Palettes

    pal_nejm NEJM Color Palettes

    pal_npg NPG Journal Color Palettes

    pal_rickandmorty Rick and Morty Color Palettes

    pal_simpsons The Simpsons Color Palettes

    pal_startrek Star Trek Color Palettes

    pal_tron Tron Legacy Color Palettes

    pal_uchicago The University of Chicago Color Palettes

    pal_ucscgb UCSC Genome Browser Color Palette

    rgb_gsea The GSEA GenePattern Color Palettes

    rgb_material Material Design Color Palettes

    scale_color_aaas AAAS Journal Color Scales

    scale_color_d3 D3.js Color Scales

    scale_color_futurama The Futurama Color Scales

    scale_color_gsea The GSEA GenePattern Color Scales

    scale_color_igv Integrative Genomics Viewer (IGV) Color Scales

    scale_color_jama Journal of the American Medical Association Color Scales

    scale_color_jco Journal of Clinical Oncology Color Scales

    scale_color_lancet Lancet Journal Color Scales

    scale_color_locuszoom LocusZoom Color Scales

    scale_color_material Material Design Color Palettes

    scale_color_nejm NEJM Color Scales

    scale_color_npg NPG Journal Color Scales

    scale_color_rickandmorty Rick and Morty Color Scales

    scale_color_simpsons The Simpsons Color Scales

    scale_color_startrek Star Trek Color Scales

    scale_color_tron Tron Legacy Color Scales

    scale_color_uchicago The University of Chicago Color Scales

    scale_color_ucscgb UCSC Genome Browser Color Scales

    scale_colour_aaas AAAS Journal Color Scales

    scale_colour_d3 D3.js Color Scales

    scale_colour_futurama The Futurama Color Scales

    scale_colour_gsea The GSEA GenePattern Color Scales

    scale_colour_igv Integrative Genomics Viewer (IGV) Color Scales

    scale_colour_jama Journal of the American Medical Association Color Scales

    scale_colour_jco Journal of Clinical Oncology Color Scales

    scale_colour_lancet Lancet Journal Color Scales

    scale_colour_locuszoom LocusZoom Color Scales

    scale_colour_material Material Design Color Palettes

    scale_colour_nejm NEJM Color Scales

    scale_colour_npg NPG Journal Color Scales

    scale_colour_rickandmorty Rick and Morty Color Scales

    scale_colour_simpsons The Simpsons Color Scales

    scale_colour_startrek Star Trek Color Scales

    scale_colour_tron Tron Legacy Color Scales

    scale_colour_uchicago The University of Chicago Color Scales

    scale_colour_ucscgb UCSC Genome Browser Color Scales

    scale_fill_aaas AAAS Journal Color Scales

    scale_fill_d3 D3.js Color Scales

    scale_fill_futurama The Futurama Color Scales

    scale_fill_gsea The GSEA GenePattern Color Scales

    scale_fill_igv Integrative Genomics Viewer (IGV) Color Scales

    scale_fill_jama Journal of the American Medical Association Color Scales

    scale_fill_jco Journal of Clinical Oncology Color Scales

    scale_fill_lancet Lancet Journal Color Scales

    scale_fill_locuszoom LocusZoom Color Scales

    scale_fill_material Material Design Color Palettes

    scale_fill_nejm NEJM Color Scales

    scale_fill_npg NPG Journal Color Scales

    scale_fill_rickandmorty Rick and Morty Color Scales

    scale_fill_simpsons The Simpsons Color Scales

    scale_fill_startrek Star Trek Color Scales

    scale_fill_tron Tron Legacy Color Scales

    scale_fill_uchicago The University of Chicago Color Scales

    scale_fill_ucscgb UCSC Genome Browser Color Scales

    函数解释:

    根据说明书我们可以简单的将它们分成三类:pal,rgb,scale,前两个可以生成不同的颜色组,scale可以直接用与ggplot中。

    PAL_:

    pal的调用都是一个模板,其中只有两个参数:

    palette的default默认参数(只用7个基础色),alpha代表透明度,取值在(0,1)间,越大越透明.

    在pal后面加上(6)代表只产生6个颜色。

    pal_aaas(palette=c("default"),alpha=1)(6)

    1

    上面是pal_aaas的一个例子,若想查看具体是哪一些颜色可以使用“scales”包来实现:

    library("scales")

    library("ggsci")

    show_col(pal_aaas("default")(7))  #图一

    show_col(pal_aaas("default", alpha = 0.6)(7))  #图二

    show_col(pal_aaas("default", alpha = 0.2)(4))  #图三

    图一至图三:

    以上是pal颜色的介绍,它的配色方案采用的是很多论文中的技巧,例如Integrative Genomics Viewer (IGV)的配色,Lancet Journal (柳叶刀)的配色,Journal of Clinical Oncology的配色等等,可以按照需求利用这些配色方案来完成绘图任务。

    RGB:

    在ggsci包中,只有rgb_gsea和rgb_material这两个基于RGB色彩模式的函数【红、绿、蓝】,但是它们的用法还是有一些差别:

    rgb_gsea(palette = c("default"), n = 12, alpha = 1, reverse = FALSE)

    rgb_material(palette = c("red", "pink", "purple", "deep-purple", "indigo",

      "blue", "light-blue", "cyan", "teal", "green", "light-green", "lime",

      "yellow", "amber", "orange", "deep-orange", "brown", "grey", "blue-grey"),

      n = 10, alpha = 1, reverse = FALSE)

    参数详解:

    n:产生多少个独立的颜色

    alpha:透明度

    reverse:逻辑值,决定颜色的排序是否反序

    palette:在rgb_material中有19种配色方案

    实例:

    library("scales")

    show_col(pal_material("indigo")(10))

    show_col(pal_material("indigo", n = 20, alpha = 0.6, reverse = TRUE)(13))

    SCALE:

    个人感觉scale函数是整个“ggsci”包中最简单和常用的包,只需要在ggplot后面+上看中的scale颜色方案,即可完成配色,下面是一些实例的使用,分别是基于柳叶刀的配色方案(scale_fill_lancet()),基于GSEA(scale_fill_gsea())和基于Integrative Genomics Viewer (IGV)的配色方案( scale_fill_igv())

    library("ggplot2")

    data("diamonds")

    ggplot(subset(diamonds, carat > 2.2 & depth > 55 & depth < 70),

          aes(x = depth, fill = cut)) +

      geom_histogram(colour = "black", binwidth = 1, position = "dodge") +

      theme_bw() + scale_fill_lancet()

    library("ggplot2")

    library("reshape2")

    data("mtcars")

    cor = cor(mtcars)

    cor_melt = melt(cor)

    ggplot(cor_melt,

          aes(x = Var1, y = Var2, fill = value)) +

      geom_tile(colour = "black", size = 0.3) +

      theme_bw() + scale_fill_gsea()

    library("ggplot2")

    data("diamonds")

    p = ggplot(subset(diamonds, carat > 2.2 & depth > 55 & depth < 70),

                aes(x = depth, fill = cut)) +

      geom_histogram(colour = "black", binwidth = 1, position = "dodge") +

      theme_bw()

    p + scale_fill_igv()

    以上便是ggsci包的简介,希望对每一个学习生信的人都有所帮助,我这里也会不断把学习中遇到的问题和经验发上来,希望志同道合的朋友能和我多多讨论,一起学习。

    参考文献

    ggsci的官网地址:https://nanx.me/ggsci/articles/ggsci.html#discrete-color-palettes

    1. 简介

    ggsci是一款优秀的ggplot2的配色包,包含了常见杂志的配色,比如lancet,jco,jama,nejm等,主要通过以下2句代码进行配色:

    scale_folor_palname

    scale_fill_palname

    所有的配色方案如下表格所示:

    2.离散型配色

    先准备2个图形,使用原始配色。

    rm(list = ls())

    library("ggsci")

    library("ggplot2")

    ## Warning: package 'ggplot2' was built under R

    ## version 4.0.5

    library("gridExtra")

    data("diamonds")

    p1 = ggplot(subset(diamonds, carat >= 2.2),

                aes(x = table, y = price, colour = cut)) +

      geom_point(alpha = 0.7) +

      geom_smooth(method = "loess", alpha = 0.05, size = 1, span = 1) +

      theme_bw()

    p2 = ggplot(subset(diamonds, carat > 2.2 & depth > 55 & depth < 70),

                aes(x = depth, fill = cut)) +

      geom_histogram(colour = "black", binwidth = 1, position = "dodge") +

      theme_bw()

    grid.arrange(p1, p2, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## AAAS配色方案

    p1_aaas = p1 + scale_color_aaas()

    p2_aaas = p2 + scale_fill_aaas()

    grid.arrange(p1_aaas, p2_aaas, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## nejm配色

    p1_nejm = p1 + scale_color_nejm()

    p2_nejm = p2 + scale_fill_nejm()

    grid.arrange(p1_nejm, p2_nejm, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## lancet

    p1_lancet = p1 + scale_color_lancet()

    p2_lancet = p2 + scale_fill_lancet()

    grid.arrange(p1_lancet, p2_lancet, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## jama

    p1_jama = p1 + scale_color_jama()

    p2_jama = p2 + scale_fill_jama()

    grid.arrange(p1_jama, p2_jama, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## jco

    p1_jco = p1 + scale_color_jco()

    p2_jco = p2 + scale_fill_jco()

    grid.arrange(p1_jco, p2_jco, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## ucscgb

    p1_ucscgb = p1 + scale_color_ucscgb()

    p2_ucscgb = p2 + scale_fill_ucscgb()

    grid.arrange(p1_ucscgb, p2_ucscgb, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## d3

    p1_d3 = p1 + scale_color_d3()

    p2_d3 = p2 + scale_fill_d3()

    grid.arrange(p1_d3, p2_d3, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## locuszoom

    p1_locuszoom = p1 + scale_color_locuszoom()

    p2_locuszoom = p2 + scale_fill_locuszoom()

    grid.arrange(p1_locuszoom, p2_locuszoom, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## igv

    p1_igv_default = p1 + scale_color_igv()

    p2_igv_default = p2 + scale_fill_igv()

    grid.arrange(p1_igv_default, p2_igv_default, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## uchicago

    p1_uchicago = p1 + scale_color_uchicago()

    p2_uchicago = p2 + scale_fill_uchicago()

    grid.arrange(p1_uchicago, p2_uchicago, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## star trek

    p1_startrek = p1 + scale_color_startrek()

    p2_startrek = p2 + scale_fill_startrek()

    grid.arrange(p1_startrek, p2_startrek, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## tron legacy

    p1_tron = p1 + theme_dark() + theme(

        panel.background = element_rect(fill = "#2D2D2D"),

        legend.key = element_rect(fill = "#2D2D2D")) +

      scale_color_tron()

    p2_tron = p2 + theme_dark() + theme(

        panel.background = element_rect(fill = "#2D2D2D")) +

      scale_fill_tron()

    grid.arrange(p1_tron, p2_tron, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## futurama

    p1_futurama = p1 + scale_color_futurama()

    p2_futurama = p2 + scale_fill_futurama()

    grid.arrange(p1_futurama, p2_futurama, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## rick and morty

    p1_rickandmorty = p1 + scale_color_rickandmorty()

    p2_rickandmorty = p2 + scale_fill_rickandmorty()

    grid.arrange(p1_rickandmorty, p2_rickandmorty, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    ## simpsons

    p1_simpsons = p1 + scale_color_simpsons()

    p2_simpsons = p2 + scale_fill_simpsons()

    grid.arrange(p1_simpsons, p2_simpsons, ncol = 2)

    ## `geom_smooth()` using formula 'y ~ x'

    3.连续性颜色配色

    ## 先用默认配色

    library("reshape2")

    data("mtcars")

    cor = cor(unname(cbind(mtcars, mtcars, mtcars, mtcars)))

    cor_melt = melt(cor)

    p3 = ggplot(cor_melt, aes(x = Var1, y = Var2, fill = value)) +

      geom_tile(colour = "black", size = 0.3) +

      theme_bw() +

      theme(axis.title.x = element_blank(),

            axis.title.y = element_blank())

    p3

    ## gsea配色

    p3_gsea    = p3 + scale_fill_gsea()

    p3_gsea_inv = p3 + scale_fill_gsea(reverse = TRUE)

    grid.arrange(p3_gsea, p3_gsea_inv, ncol = 2)

    ## material design配色

    library("reshape2")

    set.seed(42)

    k = 9

    x = diag(k)

    x[upper.tri(x)] = runif(sum(1:(k - 1)), 0, 1)

    x_melt = melt(x)

    p4 = ggplot(x_melt, aes(x = Var1, y = Var2, fill = value)) +

      geom_tile(colour = "black", size = 0.3) +

      scale_x_continuous(expand = c(0, 0)) +

      scale_y_continuous(expand = c(0, 0)) +

      theme_bw() + theme(

        legend.position = "none", plot.background = element_blank(),

        axis.line = element_blank(), axis.ticks = element_blank(),

        axis.text.x = element_blank(), axis.text.y = element_blank(),

        axis.title.x = element_blank(), axis.title.y = element_blank(),

        panel.background = element_blank(), panel.border = element_blank(),

        panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank())

    p4

    ## 使用19种material disign

    grid.arrange(

      p4 + scale_fill_material("red"),        p4 + scale_fill_material("pink"),

      p4 + scale_fill_material("purple"),      p4 + scale_fill_material("deep-purple"),

      p4 + scale_fill_material("indigo"),      p4 + scale_fill_material("blue"),

      p4 + scale_fill_material("light-blue"),  p4 + scale_fill_material("cyan"),

      p4 + scale_fill_material("teal"),        p4 + scale_fill_material("green"),

      p4 + scale_fill_material("light-green"), p4 + scale_fill_material("lime"),

      p4 + scale_fill_material("yellow"),      p4 + scale_fill_material("amber"),

      p4 + scale_fill_material("orange"),      p4 + scale_fill_material("deep-orange"),

      p4 + scale_fill_material("brown"),      p4 + scale_fill_material("grey"),

      p4 + scale_fill_material("blue-grey"),

      ncol = 6)

    4.获取配色的色值

    mypal = pal_npg("nrc", alpha = 0.7)(9)

    mypal

    ## [1] "#E64B35B2" "#4DBBD5B2" "#00A087B2"

    ## [4] "#3C5488B2" "#F39B7FB2" "#8491B4B2"

    ## [7] "#91D1C2B2" "#DC0000B2" "#7E6148B2"

    library("scales")

    ## Warning: package 'scales' was built under R

    ## version 4.0.5

    show_col(mypal)

    本文内容主要参考ef="https://cran.r-project.org/web/packages/ggsci/vignettes/ggsci.html#introduction%E3%80%82%22ggsci%22">ggsic官方网站

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