文献介绍
- 题目：Arabinoxylan Attenuates Type 2 diabetes by Improvement of Carbohydrate, Lipid And Amino Acid Metabolism
- 译名：阿拉伯聚糖改善碳水化合物、脂质及氨基酸代谢减弱2型糖尿病
- 期刊：「Molecular Nutrition and Food Research」
- 影响因子：5.151
- 发表时间：13 September 2018
- 通讯作者：聂少平
- 通讯地址：南昌大学；生命科学与食品工程学院；食品科学与技术国家重点实验室
摘要
- 高脂饮食和链脲佐菌素诱导大鼠的2型糖尿病（T2D），研究车前子来源的阿拉伯木聚糖对T2D大鼠尿样代谢组学的影响；
- T2D大鼠
丙酮、葡萄糖、2-氧戊二酸和亮氨酸水平显著增加，肌酸、组氨酸、赖氨酸、L-色氨酸，马尿酸盐、L-半胱氨酸、犬尿氨酸和阿拉伯糖醇浓度显著降低，这12种代谢物可用作T2D的生物标志物； - 阿拉伯木聚糖影响代谢的途径主要涉及
三羧酸循环，以及脂质、酮体、牛磺酸、亚牛磺酸、色氨酸和支链氨基酸代谢。
材料与方法
动物实验设计
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具体的实验设计为如下思维导图：
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代谢组学实验
样品处理
- 质谱分析前，尿液样品冻存于-80度冰箱，用时在冰上溶解后再4度10,000rpm离心10分钟
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QC样品由每个样品等量混合，用于监控仪器稳定性和获得高质量代谢组学数据 - 进样前，先进3针QC样品用于平衡系统，然后整个实验过程中每隔6个样品插一针QC样品
液相质谱方法
液相方法
- 液相系统为岛津 Nexera X2 UHPLC system，色谱分离用的色谱柱为Shim -pack GIST C18 column（温度为30℃）
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色谱分离条件：
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质谱条件
- 质谱系统为AB公司 Triple TOF 5600 mass analyzer with information dependent acquisition (IDA，信息关联数据采集模式).
- 质谱仪器参数设定： collision energy (CE): 35 (positive) and -35 V (negative); collision energy spread (CES): 15 V;
declustering potential (DP): 80 (positive) and -80 V (negative); ion spray voltage: +5500 (positive) and -4500 V (negative); mass range: 50 to 1000 m/z - 数据分析：PeakView + XCMS（XCMS参数设定： centWave for feature detection (Δm/z= 5 ppm, minimum peak width = 5 s,
and maximum peak width = 20 s); obiwarp settings for retention-time correction (profStep = 1); and parameters for
chromatogram alignment, including mzwid =0.025, minfrac = 0.5, and bw = 5） - 物质初步鉴定：Identification of the metabolites was supported on MS and MS/MS information by searching in the METLIN MS and MS/MS database (http://metlin.scripps.edu)
代谢组学数据分析
- 分析软件：Metaboanalyst 4.0
- 数据处理：normalization including sample normalization (total ion current), data transformation (log transformation) and data scaling (Pareto scaling)
- 多元统计分析： Partial least-square-discrimination analysis (PLS-DA), principal component analysis (PCA), variable importance in the projection (VIP)
用于筛选代谢物标记物 - 单变量统计分析：Spss 18.0软件（t-test）
结果（节选）
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作者根据分析得出的代谢物标记物，构建了一个代谢物通路图，值得借鉴
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