21.植物中先锋转录因子

作者: 夏大希 | 来源:发表于2022-08-17 19:44 被阅读0次

21.植物中先锋转录因子
R-SCENIC pipline
大麦转录因子分析
2分钟内，找出全部人类的转录因子敲降/敲除的基因表达谱（Knoc
转录调控：转录因子特征总结[转载]
Master transcription factors for
ChIP-Seq分析
RIP-Seq（2）--数据来源及质控
如何预测转录因子靶基因！
Nature-线粒体胁迫通过OMA1-DELE1-HRI通路向细

看人类中的文献中，发现人类胚胎发育的过程中研究胚胎发育过程中控制基因时间表达的先锋转录因子Zelda，

image.png ，反思到自己做转录组数据关于大麦小穗发育全生育期过程中的基因好多富集到DNA复制、基因表达负调控相关的基因，现在的数据分析思路是对于每个cluster进行GO，发现一些基因的动力学特征，但是哪些基因对这些基因的表达进行调控其特定时间表达是我最终感兴趣的方向。所以查找在植物中研究先锋转录因子的文章。总共有两篇，一篇是NC上的

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一篇是MC上的一篇

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植物中研究先锋转录因子的主要是控制开花基因LEAFY,Nature Comm. | 金润博士等揭示花发育基因LEAFY的先锋转录因子特性及其生物学机制 - 知乎 (zhihu.com)

21.植物中先锋转录因子
看人类中的文献中，发现人类胚胎发育的过程中研究胚胎发育过程中控制基因时间表达的先锋转录因子Zelda，，反思到自...
R-SCENIC pipline
SCENIC 功能说明：基于物种转录因子数据库，用以识别单细胞转录组数据中的转录因子(TFs)和对应的靶标基因...
大麦转录因子分析
转录因子分析的流程一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Trans...
2分钟内，找出全部人类的转录因子敲降/敲除的基因表达谱（Knoc
转录因子（Transcription Factor, TF）及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用，转录因子...
转录调控：转录因子特征总结[转载]
转录调控：转录因子特征总结典型的转录因子功能示意图(Schematic of a prototypical TF...
Master transcription factors for
中文标题：在食管腺癌中核心转录因子形成了相互作用的回路并且策划了转录网络文章主要思想： 1）少部分核心转录因子通...
ChIP-Seq分析
植物转录因子 ChIP-Seq 实战系列 - 质量控制篇 https://mp.weixin.qq.com/s?_...
RIP-Seq（2）--数据来源及质控
数据来源转录因子CBFB通过调控翻译和转录抑制乳腺癌CBFB基因最近在各种癌症中成为高度突变的驱动因子，CBFB...
如何预测转录因子靶基因！
做完转录组分析完之后，一般会找到一些差异表达的基因。差异表达基因中如果有转录因子的话，可以研究一下转录因子调控哪些...
Nature-线粒体胁迫通过OMA1-DELE1-HRI通路向细
在哺乳动物细胞中，线粒体功能障碍会引发整合应激响应，真核转录起始因子eIF2α的磷酸化导致转录因子ATF4的转录起...