退化性疾病是当今21世纪造成人类死亡的主要元凶之一，而炎症反应正是所有退化性疾病的核心。已发现的炎症标记物，如C反应蛋白和IL-6的升高会致使包括心血管疾病、神经退化性疾病、癌症、黄斑变性、糖尿病、高血压在内的多种疾病的死亡率升高。识别造成患者炎症反应的近中央触发因子是非常重要的一步。在通常情况下，饮食是炎症反应最显著的调节因素，高糖饮食、久坐的生活方式是导致多种炎症和退化性疾病的主要原因。
其他的致炎因素包括饱和脂肪酸和反式脂肪酸、咖啡因、过量饮酒、缺乏抗氧化剂、微量营养素缺乏以及低纤维饮食（将会对肠道菌群产生不利影响，使肠道菌群过多的暴露在代谢和环境毒素之中）。
我们已经知道许多调理炎症的药理手段：阿司匹林、非载体抗炎药（NSAIDs）和非传统的他汀类药物、噻唑烷二酮和贝特类药物。但是，我们遵循全面健康的生活方式则会收到比药理手段更好的治疗效果。为了减少机体炎症反应，我们应该减少饮食中的饱和脂肪、反式脂肪和糖类含量，提高多种维生素的摄入量，补充抗氧化剂（炎症调解中细胞信号传导的基因转录因子），多摄入w-3脂肪酸、纤维素、益生菌并且形成定期锻炼的习惯，这些方面的干预都可以降低整个疾病谱的总体发病率和死亡率。
食物过敏、GALT和免疫系统都与慢性疾病有着很强的联系。各类食物过敏，以及饮食在肠道微生态和GALT的激活中的作用都有着重要的临床意义。
食物过敏不是一个单一的疾病，它不是单单由病理生理紊乱而引起的，食物过敏（或敏感）可以被定义为不益的免疫或者食物反应。这种反应可能是抗体或者细胞介导的，同时，也有很多食物产生的反应是免疫介导的情况出现，包括食物不耐受（如乳糖）和食物过敏（如防腐剂、添加剂、甜味剂等）。经典的食物过敏症状已经被医学界认为是IgE的依赖而引起的急性发作（荨麻疹、哮喘或者过敏症）症状。因此，食物过敏的起因，要么是IgE的相关延迟性发病（特应性皮炎），要么是细胞介导的延迟和缓慢（腹腔病）。
通过排除饮食和激发饮食，以及一定程度的IgE抗体检测，临床医生已经明确了一些炎症触发因子导致的慢性疾病症状。机体对排除饮食的反应包括：头痛、肠易激综合征、疲劳、自身免疫性疾病、慢性鼻窦炎、关节炎、皮肤炎症疾病、纤维肌痛、CFIDS等。而这些疾病往往是多方面的，饮食便是导致持久性GALT长期存在的因素。食物过敏或慢性GLAT可能会主要由细胞介导引起，也可能是由抗体介导引起，或者两者兼而有之。然而，在大多数情况下，一些突发事件扰乱了肠道黏膜的完整性，导致有基因、蛋白质和微生物抗原介导的GALT的激活。这种情况将会启动Th2型过敏反应或自身免疫反应。然后随之而来的便是全身性的疾病，并伴随着其他难以治疗的疾病。消除饮食是一个非常强大但未被充分利用的工具，它可以被临床医生用来解决慢性疾病。
当肠道黏膜屏障受损的时候，机体对常见食物的口服耐药性就会大打折扣。因此，肠道黏膜屏障必须在许多重要的功能活动中与机体保持一个微妙的平衡。这些功能活动包括：低于肠道菌群的微生物抗原，建立对病原体的快速反应机制，允许机体吸收无害的食物抗原，以及促进（或抑制）炎症反应。通过改变饮食习惯来使得肠道菌群正常化，并重新建立正常的肠道黏膜屏障的完整性是降低慢性过敏和炎症性疾病发病率的关键。
因为机体的健康和疾病状态之间的联系就像一张大网，辨别特定疾病的病因或影响将会是非常困难的过程（有时甚至是无关的）。任何剔除破坏病原体和促进平衡的手段都能在临床上发挥极其重要的作用。
食物过敏或敏感可能是肠道黏膜完整性损害的原因或者结果。为了解决临床问题，我们必须把注意力同时放在剔除破坏病源（永久性，如在腹腔疾病的免疫反应情况下；或者暂时性，在后天的抗体食物过敏情况下）和恢复正常的肠道微生物黏膜完整性这两个方面上。
炎症状态和临床疾病的交汇点，以及治愈这些疾病的治疗方法是功能医学最擅长的领域，用功能医学解释这些情况也会得到最有效、最满意的效果。饮食习惯和生活方式是造成慢性退化性疾病、慢性炎症和免疫疾病的两个最主要原因，而以下的这些方法则会使患者能够获得最大的临床效果。
【20180614】炎症和慢性疾病
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