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预处理步骤:ALFF、fALFF、ReHo、FC和FCD

预处理步骤:ALFF、fALFF、ReHo、FC和FCD

作者: 养猪场小老板 | 来源:发表于2023-03-10 16:14 被阅读0次

1.ALFF: 低频振幅, 表示功能活动的强度

预处理: NARWSDC + 计算指标 + mALFF/zALFF

fALFF : (分数ALFF,比例ALFF ): 低频振幅占全频段振幅的比例(取值0~1)

fALFF预处理: NARWSDC + 计算指标(和ALFF一样)+ mfALFF/zfALFF

2.ReHo :局部一致性

预处理: NARWDCF (不做平滑)+ 计算指标 + 平滑指标 + smReho/szReho

3.FC functional connectivity 功能连接 :大脑里两个不同区域功能活动的一致性

(1) 基于种子点的全脑功能连接:seed-based FC / voxel-wise FC
seed: 感兴趣区roi : 海马脑区
预处理: NARWSDCF (所有步骤都做)+ 计算FC + ZFC(fisher's z变换后的FC)

(2) ROI-wise FC 脑区水平FC

4个ROI,提取每个ROI的平均时间序列,两两计算皮尔逊相关;6种;
        ROI 1-2,  ROI 1-3, ROI 1-4, ROI 2-3 ,ROI 2-4, ROI 3-4

预处理:NARWDCF (不做平滑)+ 计算FC + ZFC(fisher's z变换后的FC)

第一步:确定感兴趣区ROI---mask文件: 1.从图谱提取 2.画小球(脑区坐标,半径=5~10mm)
注意:ROI文件的维度、体素大小必须和预处理后的功能数据保持一致!
如果不一致,需要对ROI文件做重切(reslice).

注意: FC指标标准化方式为Fisher's z变换;
  1. FCD 功能连接密度: global FCD / Degree centrality (voxel-wise)
预处理:NARWDCF (不做平滑) + 计算指标 + 平滑指标 + smDC/szDC

二值的: 通过阈值的连接的个数
加权的: 通过阈值的连接值之和

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